RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM193AP78312 1265 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CALCOCO2Q13137 446 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DPYSL3Q14195 570 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CFAP58Q5T655 872 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCHCR1Q8TD31 782 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NT5C3BQ969T7 300 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNF8Q96H20 258 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SH3GL2Q99962 352 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM118BQ9BPY3 351 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNGB3Q9NQW8 809 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCN5AQ14524 2016 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HHLA1C9JL84 531 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLRC2P26717 231 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSD17B3P37058 310 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC25A52Q3SY17 297 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF365Q70YC5 407 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALLCQ8N6M5 410 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR10T2Q8NGX3 314 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZIM3Q96PE6 472 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC2A13Q96QE2 648 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CALN1Q9BXU9 219 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADAM33Q9BZ11 813 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 F8W810 466 aa22.83■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa22.83■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TP73O15350 636 aa22.83■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APOC2P02655 101 aa22.83■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CAV1Q03135 178 aa22.83■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TERF2Q15554 542 aa22.83■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCYL2Q6P3W7 929 aa22.83■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BNIPLQ7Z465 357 aa22.83■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DEFB106AQ8N104 65 aa22.83■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.83■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.83■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.83■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CXCL10P02778 98 aa22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATF2P15336 505 aa22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOS2P35228 1153 aa22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NDUFV1P49821 464 aa22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CACNA2D1P54289 1103 aa22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DAOAP59103 153 aa22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSPY1Q01534 308 aa22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TFDP2Q14188 446 aa22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RFX6Q8HWS3 928 aa22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACTL9Q8TC94 416 aa22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM149B1Q96BN6 582 aa22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RUFY1Q96T51 708 aa22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNK16Q96T55 309 aa22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PNPLA8Q9NP80 782 aa22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WBP1LQ9NX94 342 aa22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF148Q9UQR1 794 aa22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OPA1O60313 960 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DPYSL2Q16555 572 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERMARDQ5T6L9 678 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RHBDF2Q6PJF5 856 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRIG3Q6UXM1 1119 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABI1Q8IZP0 508 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BBOF1Q8ND07 529 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAF2Q96CS3 445 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TOX2Q96NM4 488 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NPY6RQ99463 290 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF670Q9BS34 389 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ULBP1Q9BZM6 244 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POPDC2Q9HBU9 364 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDH18Q9HCL0 1135 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRAPPC3O43617 180 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OAZ2O95190 189 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT14P02533 472 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR1G1P47890 313 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DYNLT1P63172 113 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT81Q14533 505 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GSTA5Q7RTV2 222 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCML4Q8N228 414 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HAUS1Q96CS2 278 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF157Q96PX1 679 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STAP1Q9ULZ2 295 aa22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms