RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000022356.11

Usp54-201, Transcript of Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Usp54, Length 6,580 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54-201ENSMUST00000022356 Orc3Q9JK30 715 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 PygmQ9WUB3 842 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Pcna-ps2A0A140T8V5 261 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 E2f6O54917 272 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Kcna1P16388 495 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Tac1P41539 130 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 CratP47934 626 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Psma2P49722 234 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Cpne7Q0VE82 557 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Pnpla5Q32LZ8 432 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Lrrc47Q505F5 581 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Pacsin1Q61644 441 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Rassf6Q80UQ2 353 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ces2cQ91WG0 561 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Tmem192Q9CXT7 266 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 PnkpQ9JLV6 522 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 ChmQ9QXG2 665 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Oas1eA0A0J9YV76 386 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gm21962L7N280 338 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Itgb7P26011 806 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Prickle1Q3U5C7 832 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Cldn11Q60771 207 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Mib1Q80SY4 1006 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Crls1Q80ZM8 303 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Znf771Q8BJ90 317 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 OafQ8QZR4 282 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Zdhhc12Q8VC90 267 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Slc44a4Q91VA1 707 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Csde1Q91W50 798 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Bbox1Q924Y0 387 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Card14Q99KF0 999 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gpihbp1Q9D1N2 228 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Heg1E9Q7X6 1337 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Atp2c2A7L9Z8 944 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 6030498E09RikB1AX85 169 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Hes2O54792 157 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Igf2bp1O88477 577 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gabpb1Q00420 383 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gpd2Q64521 727 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Q8CCC3 530 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Nkiras1Q8CEC5 192 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ints4Q8CIM8 964 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 BbxQ8VBW5 907 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Pcdhb1Q91Y08 818 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 NgrnQ99KS2 293 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Myo1hQ9D6A1 958 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Eef1akmt2Q9D853 244 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Armc4B2RY50 1037 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Psen1P49769 467 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Lhx1P63006 406 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Spag6Q3V0U9 509 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gm4952Q5FW57 296 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 SynaQ5G5D5 617 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Akt2Q60823 481 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfml3Q8BK62 406 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Tmem134Q8R0J4 195 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 AagabQ8R2R3 316 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Oxnad1Q8VE38 311 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ecrg4Q99LS0 148 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ndufab1Q9CR21 156 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Spata9Q9D9R3 252 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Pabpc4lG5E8X2 370 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 PklrP53657 574 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Zhx1P70121 873 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 GsapQ3TCV3 858 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Zfp868Q3UTQ6 422 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Slc10a5Q5PT54 434 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ksr1Q61097 873 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Lrrc75bQ7TPD7 306 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Trim50Q810I2 483 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Fbxo28Q8BIG4 368 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Edem1Q925U4 652 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Chmp1b2Q9CQD4 199 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Golph3Q9CRA5 298 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Stx11Q9D3G5 287 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Dmap1Q9JI44 468 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Tyw5A2RSX7 315 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Slc1a2P43006 572 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Plcl1Q3USB7 1096 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Nr1h4Q60641 488 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr1080Q7TR67 313 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Rmnd5aQ80YQ8 391 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Dcun1d2Q8BZJ7 259 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Btbd7Q8CFE5 1130 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Aldh4a1Q8CHT0 562 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ago4Q8CJF8 861 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 MefvQ9JJ26 767 aa8.32□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Qser1A2BIE1 1698 aa8.31□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Phldb3E9QAF4 648 aa8.31□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Vmn2r19G5E8G4 854 aa8.31□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Psmd4O35226 376 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Fgf10O35565 209 aa8.31□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Itgb3O54890 787 aa8.31□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Vps26aP40336 327 aa8.31□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 NcstnP57716 708 aa8.31□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Myl6Q60605 151 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Grik1Q60934 836 aa8.31□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Lcp1Q61233 627 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Elmo2Q8BHL5 732 aa8.31□□□□□ -1.08
Usp54-201ENSMUST00000022356 Tmem63cQ8CBX0 802 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.5 ms