RNA–Protein interactions for RNA: YHR029C

YHI9, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YHI9, Length 885 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHI9	YHR029C	JJJ2	P46997	583 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YHI9	YHR029C	RNH70	P53331	553 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YHI9	YHR029C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
YHI9	YHR029C	SWE1	P32944	819 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YHI9	YHR029C	POL32	P47110	350 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YHI9	YHR029C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
YHI9	YHR029C	IRE1	P32361	1115 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	PPG1	P32838	368 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	SWI5	P08153	709 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	UBX7	P38349	436 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	ERP5	P38819	212 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	SVF1	Q05515	481 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	GAL2	P13181	574 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	ATE1	P16639	503 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	TOM20	P35180	183 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	BOI2	P39969	1040 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	THI12	P42883	340 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	THI5	P43534	340 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	YFL034W	P43564	1073 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	THI11	P47183	340 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	THI13	Q07748	340 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	YOL098C	Q12496	1037 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	OSW7	P43611	510 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	UBX5	Q06682	500 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	MCA1	Q08601	432 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	FPS1	P23900	669 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	TSR4	P25040	408 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	SEC8	P32855	1065 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	YHL050C	P38721	697 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	YHR219W	P38900	624 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	KAR5	Q04746	504 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	YDR215C	Q12240	137 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	PSH1	Q12161	406 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	NTH2	P35172	780 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	MRPL16	P38064	232 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	YPQ2	Q06328	317 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	STB3	Q12427	513 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YHI9	YHR029C	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	LSB6	P42951	607 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.08	□□□□□ -1.6	not detected
YHI9	YHR029C	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	GIN4	Q12263	1142 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	TSC13	Q99190	310 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	PHO87	P25360	923 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	MGE1	P38523	228 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	VAC8	P39968	578 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	YTA6	P40328	754 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	TPO2	P53283	614 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	TAT1	P38085	619 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	MDJ2	P42834	146 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	MCM1	P11746	286 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	MET1	P36150	593 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	PPX1	P38698	397 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
YHI9	YHR029C	BOL3	P39724	118 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	ROM1	P53046	1155 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	WHI5	Q12416	295 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	CYT1	P07143	309 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	HAP4	P14064	554 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	MAC1	P35192	417 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	PRY1	P47032	299 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	YNL165W	P53891	406 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	PNP1	Q05788	311 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	CIT2	P08679	460 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	SPR3	P41901	512 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	ATG1	P53104	897 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	ALG12	P53730	551 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YHI9	YHR029C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	MLF3	P32047	452 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	ALD3	P54114	506 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	PUN1	Q06991	263 aa		5.02	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.5 ms