RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, human

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ANKRD28-215	ENST00000624145	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	COG3	Q96JB2	828 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	NUCB2	P80303	420 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	WASHC4	Q2M389	1173 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	MTMR7	Q9Y216	660 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	SDF4	Q9BRK5	362 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	SMC2	O95347	1197 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	NUTM2F	A1L443	756 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	STAMBP	O95630	424 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	SLC4A3	P48751	1232 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	USP8	P40818	1118 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	NLRP13	Q86W25	1043 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	DEF6	Q9H4E7	631 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	PSMA5	P28066	241 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	NF2	P35240	595 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	STIM1	Q13586	685 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145		E9PSI1	815 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	ERLIN1	O75477	346 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	TAF3	Q5VWG9	929 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	KIF3B	O15066	747 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	NUP155	O75694	1391 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	CENPH	Q9H3R5	247 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	DACH1	Q9UI36	760 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	FEZ1	Q99689	392 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	PDE4A	P27815	886 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	NECTIN2	Q92692	538 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	CEP63	Q96MT8	703 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	KIF15	Q9NS87	1388 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	KDM4A	O75164	1064 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	POTEJ	P0CG39	1038 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	ATP2B1	P20020	1258 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	ANAPC15	P60006	121 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	PLIN1	O60240	522 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	SPATA24	Q86W54	205 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	CNTROB	Q8N137	903 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	4.8	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	SERPINC1	P01008	464 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	CETN2	P41208	172 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	UACA	Q9BZF9	1416 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	ATP2B2	Q01814	1243 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANKRD28-215	ENST00000624145	FOXD1	Q16676	465 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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