RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 CCP110O43303 1012 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 CRBNQ96SW2 442 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 TAF3Q5VWG9 929 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 EEA1Q15075 1411 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 PDE3BQ13370 1112 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC181Q5TID7 509 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 SPC24Q8NBT2 197 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 ROCK1Q13464 1354 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 RNF214Q8ND24 703 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM193AP78312 1265 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 TXLNAP40222 546 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 KINO60870 393 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 DEF6Q9H4E7 631 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 GIMAP7Q8NHV1 300 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 WASHC4Q2M389 1173 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 NLRP13Q86W25 1043 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 COG6Q9Y2V7 657 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 KIF15Q9NS87 1388 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 RABEP1Q15276 862 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 ERC2O15083 957 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 USP8P40818 1118 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 E9PSI1 815 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 SERPINC1P01008 464 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 COG3Q96JB2 828 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 TSPY26PQ9H489 355 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 PSMA5P28066 241 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 NUP155O75694 1391 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 ATP2B1P20020 1258 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 NEBLO76041 1014 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 CEP63Q96MT8 703 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 ERICH4A6NGS2 130 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC91Q7Z6B0 441 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 MRE11P49959 708 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 STIM1Q13586 685 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 CNTROBQ8N137 903 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 DESP17661 470 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 IQCEQ6IPM2 695 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 ATP2B2Q01814 1243 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 TICAM2Q86XR7 235 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 LNPKQ9C0E8 428 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 CFAP45Q9UL16 551 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 STAMBPO95630 424 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 ERLIN1O75477 346 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 PRDM2Q13029 1718 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 SSR1P43307 286 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 TRAK2O60296 914 aa22.08■■□□□ 1.13
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