RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-209ENST00000473406 PRR7Q8TB68 274 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-209ENST00000473406 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.83□□□□□ -0.841e-9■■■□□ 15.1
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RABGGTB-209ENST00000473406 MTMR2Q13614 643 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-209ENST00000473406 CDCA8Q53HL2 280 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-209ENST00000473406 RSPH4AQ5TD94 716 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-209ENST00000473406 PACS2Q86VP3 889 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-209ENST00000473406 BCL2L12Q9HB09 334 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-209ENST00000473406 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
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RABGGTB-209ENST00000473406 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-209ENST00000473406 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-209ENST00000473406 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.81□□□□□ -0.84
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RABGGTB-209ENST00000473406 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
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RABGGTB-209ENST00000473406 DOK7Q18PE1 504 aa9.78□□□□□ -0.84
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RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.77□□□□□ -0.85
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RABGGTB-209ENST00000473406 ATP9BO43861 1147 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-209ENST00000473406 SLF2Q8IX21 1173 aa9.76□□□□□ -0.85
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RABGGTB-209ENST00000473406 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa9.76□□□□□ -0.85
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RABGGTB-209ENST00000473406 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-209ENST00000473406 C6orf229H3BNL8 230 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-209ENST00000473406 RIMBP2O15034 1052 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC10A3P09131 477 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-209ENST00000473406 NR6A1Q15406 480 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR153Q6NV75 609 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-209ENST00000473406 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-209ENST00000473406 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-209ENST00000473406 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-209ENST00000473406 PROX2Q3B8N5 592 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGGTB-209ENST00000473406 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGGTB-209ENST00000473406 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
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RABGGTB-209ENST00000473406 UNCXA6NJT0 531 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-209ENST00000473406 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM164Q5U3C3 297 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-209ENST00000473406 STK32AQ8WU08 396 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-209ENST00000473406 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-209ENST00000473406 TXNDC2Q86VQ3 553 aa9.68□□□□□ -0.86
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RABGGTB-209ENST00000473406 FUT2Q10981 343 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-209ENST00000473406 NR1H3Q13133 447 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-209ENST00000473406 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
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RABGGTB-209ENST00000473406 USP17L4A6NCW7 530 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 ERCC3P19447 782 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 USP17L2Q6R6M4 530 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.64□□□□□ -0.87
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RABGGTB-209ENST00000473406 USP35Q9P2H5 1018 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXO45P0C2W1 286 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM196BA6NMK8 535 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 USP17L5A8MUK1 530 aa9.62□□□□□ -0.87
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RABGGTB-209ENST00000473406 SKIP12755 728 aa9.62□□□□□ -0.87
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RABGGTB-209ENST00000473406 ATP6V1AP38606 617 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 RETREG3Q86VR2 466 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNH8Q96L42 1107 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBBXA8MT70 800 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 DESI1Q6ICB0 168 aa9.61□□□□□ -0.87
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RABGGTB-209ENST00000473406 USP17L10C9JJH3 530 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 USP17L12C9JPN9 530 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 USP17L11C9JVI0 530 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 USP17L21D6R901 530 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 USP17L18D6R9N7 530 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 USP17L22D6RA61 530 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 USP17L19D6RCP7 530 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 USP17L20D6RJB6 530 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 POTEIP0CG38 1075 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 SSFA2P28290 1259 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 USP17L24Q0WX57 530 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-209ENST00000473406 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
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