RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC175P0C221 793 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 MCM5P33992 734 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 SEMA3FQ13275 785 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 MFSD4BQ5TF39 518 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC181Q5TID7 509 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 ICE2Q659A1 982 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 MIPOL1Q8TD10 442 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC112Q8NEF3 446 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 RAI14Q9P0K7 980 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 TCHPQ9BT92 498 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 INCENPQ9NQS7 918 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 NISCHQ9Y2I1 1504 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 NUP133Q8WUM0 1156 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 NGEFQ8N5V2 710 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 IVLP07476 585 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 CENPHQ9H3R5 247 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 IFT57Q9NWB7 429 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 ZBTB22O15209 634 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 TSPY4P0CV99 314 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 TSPY10P0CW01 314 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 NUCB2P80303 420 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 KCNH8Q96L42 1107 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 NINLQ9Y2I6 1382 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 KIF3CO14782 793 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 INF2Q27J81 1249 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 KIF16BQ96L93 1317 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 FAM114A1Q8IWE2 563 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 RNF20Q5VTR2 975 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 EGFL6Q8IUX8 553 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 BACH2Q9BYV9 841 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 MAFGO15525 162 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 GCKP35557 465 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 FAM210AQ96ND0 272 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 SUFUQ9UMX1 484 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 MCM4P33991 863 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 CASQ1P31415 396 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 RINLQ6ZS11 566 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 PPM1EQ8WY54 764 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 OTUD6BQ8N6M0 293 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 PANK2Q9BZ23 570 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 WDR63Q8IWG1 891 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 HMMRO75330 724 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 SIN3AQ96ST3 1273 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 SMC2O95347 1197 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 TRDNQ13061 729 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 RGL3Q3MIN7 710 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 UIMC1Q96RL1 719 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 NUDCQ9Y266 331 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 TONSLQ96HA7 1378 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 EZRP15311 586 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 MICALCLQ6ZW33 695 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 NAA25Q14CX7 972 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 NPHP1O15259 732 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 DCTN1Q14203 1278 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 TMCO3Q6UWJ1 677 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.5 ms