RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 CTDSPL2Q05D32 466 aa7.36□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 PRR7Q8TB68 274 aa7.36□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa7.35□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 ERCC3P19447 782 aa7.35□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 USP46P62068 366 aa7.35□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 SEMA3FQ13275 785 aa7.35□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 C3orf67Q6ZVT6 689 aa7.35□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.35□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 IGSF5Q9NSI5 407 aa7.35□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 FDX1P10109 184 aa7.34□□□□□ -1.23
CBX1P4-201ENST00000439415 HOXA2O43364 376 aa7.33□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 RDH13Q8NBN7 331 aa7.33□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.33□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM198AQ9UFP1 575 aa7.33□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP9BO43861 1147 aa7.32□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.32□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.32□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 PNMA1Q8ND90 353 aa7.32□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.32□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 MTMR2Q13614 643 aa7.31□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.31□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRN4Q8WUT4 740 aa7.31□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 NBPF26B4DH59 902 aa7.3□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 TSC1Q92574 1164 aa7.3□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHGC3Q9UN70 934 aa7.3□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 GCGRP47871 477 aa7.29□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 TSKSQ9UJT2 592 aa7.29□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.28□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.28□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 TATDN2Q93075 761 aa7.28□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 SIRT1Q96EB6 747 aa7.28□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 PNMA3Q9UL41 463 aa7.28□□□□□ -1.24
CBX1P4-201ENST00000439415 SLF2Q8IX21 1173 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 CFAP99D6REC4 459 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 COL9A1P20849 921 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 GUCA2AQ02747 115 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 NR6A1Q15406 480 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 PACS2Q86VP3 889 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 STK32AQ8WU08 396 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.24□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 C3orf80F5H4A9 247 aa7.24□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 ST18O60284 1047 aa7.24□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 SSFA2P28290 1259 aa7.24□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.24□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.23□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.23□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 C6orf229H3BNL8 230 aa7.23□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 NUDT7P0C024 238 aa7.23□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 HLA-CQ95604 372 aa7.23□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 USP17L3A6NCW0 530 aa7.22□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 USP17L4A6NCW7 530 aa7.22□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM196BA6NMK8 535 aa7.22□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 NR1H3Q13133 447 aa7.22□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.22□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 USP17L2Q6R6M4 530 aa7.22□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.22□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa7.22□□□□□ -1.25
CBX1P4-201ENST00000439415 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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CBX1P4-201ENST00000439415 BCL2L12Q9HB09 334 aa7.21□□□□□ -1.26
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CBX1P4-201ENST00000439415 PIK3CDO00329 1044 aa7.2□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 SKIP12755 728 aa7.2□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 TCF3P15923 654 aa7.2□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 PTPREP23469 700 aa7.2□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.2□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 GIPC2Q8TF65 315 aa7.2□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 USP17L5A8MUK1 530 aa7.19□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 USP17L15C9J2P7 530 aa7.19□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 USP17L10C9JJH3 530 aa7.19□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 USP17L13C9JLJ4 530 aa7.19□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 USP17L12C9JPN9 530 aa7.19□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 USP17L11C9JVI0 530 aa7.19□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 USP17L21D6R901 530 aa7.19□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 USP17L18D6R9N7 530 aa7.19□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 USP17L22D6RA61 530 aa7.19□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.19□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 USP17L19D6RCP7 530 aa7.19□□□□□ -1.26
CBX1P4-201ENST00000439415 USP17L20D6RJB6 530 aa7.19□□□□□ -1.26
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