RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428344.1

AC008073.2-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AC008073.2, Length 792 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC008073.2-201ENST00000428344 EPS8L1Q8TE68 723 aa10.61□□□□□ -0.71
AC008073.2-201ENST00000428344 PNMA3Q9UL41 463 aa10.61□□□□□ -0.71
AC008073.2-201ENST00000428344 NBPF26B4DH59 902 aa10.6□□□□□ -0.71
AC008073.2-201ENST00000428344 ATP9BO43861 1147 aa10.6□□□□□ -0.71
AC008073.2-201ENST00000428344 GCGRP47871 477 aa10.6□□□□□ -0.71
AC008073.2-201ENST00000428344 MTMR2Q13614 643 aa10.6□□□□□ -0.71
AC008073.2-201ENST00000428344 RSPH4AQ5TD94 716 aa10.6□□□□□ -0.71
AC008073.2-201ENST00000428344 PNMA1Q8ND90 353 aa10.6□□□□□ -0.71
AC008073.2-201ENST00000428344 TATDN2Q93075 761 aa10.6□□□□□ -0.71
AC008073.2-201ENST00000428344 TSKSQ9UJT2 592 aa10.6□□□□□ -0.71
AC008073.2-201ENST00000428344 COL9A1P20849 921 aa10.59□□□□□ -0.71
AC008073.2-201ENST00000428344 GUCA2AQ02747 115 aa10.59□□□□□ -0.71
AC008073.2-201ENST00000428344 C3orf80F5H4A9 247 aa10.58□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 TXNDC2Q86VQ3 553 aa10.58□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 ERCC3P19447 782 aa10.57□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP10.57□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 IGSF5Q9NSI5 407 aa10.57□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 TMEM164Q5U3C3 297 aa10.56□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 PACS2Q86VP3 889 aa10.56□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 CFAP99D6REC4 459 aa10.55□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 NUDT7P0C024 238 aa10.55□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 SLF2Q8IX21 1173 aa10.55□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 HLA-CQ95604 372 aa10.55□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 NR6A1Q15406 480 aa10.54□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 POTEFA5A3E0 1075 aa10.53□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 C6orf229H3BNL8 230 aa10.53□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 STK32AQ8WU08 396 aa10.53□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 SLC39A7Q92504 469 aa10.53□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa10.53□□□□□ -0.72
AC008073.2-201ENST00000428344 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa10.51□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 HAX1O00165 279 aa10.51□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 SMAPO00193 183 aa10.51□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa10.51□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP10.51□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa10.5□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 SIRT1Q96EB6 747 aa10.5□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 EVX2Q03828 476 aa10.49□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 ARSIQ5FYB1 569 aa10.49□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 C7P10643 843 aa10.48□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 SSFA2P28290 1259 aa10.48□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 GRIPAP1Q4V328 841 aa10.48□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 BCL2L13Q9BXK5 485 aa10.48□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 BCL2L12Q9HB09 334 aa10.48□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 PIK3CDO00329 1044 aa10.47□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 SLC10A3P09131 477 aa10.47□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 PTPREP23469 700 aa10.47□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 NR1H3Q13133 447 aa10.47□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa10.47□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 SOWAHDA6NJG2 315 aa10.46□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 SKIP12755 728 aa10.46□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa10.46□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 DCBLD2Q96PD2 775 aa10.46□□□□□ -0.73
AC008073.2-201ENST00000428344 USP17L3A6NCW0 530 aa10.45□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 USP17L4A6NCW7 530 aa10.45□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 USP17L2Q6R6M4 530 aa10.45□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 USP17L1Q7RTZ2 530 aa10.45□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 MARSP56192 900 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 FAM196BA6NMK8 535 aa10.43□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa10.43□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 FAM200AQ8TCP9 573 aa10.43□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 GIPC2Q8TF65 315 aa10.43□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 USP17L5A8MUK1 530 aa10.42□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 USP17L15C9J2P7 530 aa10.42□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 USP17L10C9JJH3 530 aa10.42□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 USP17L13C9JLJ4 530 aa10.42□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 USP17L12C9JPN9 530 aa10.42□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 USP17L11C9JVI0 530 aa10.42□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 USP17L21D6R901 530 aa10.42□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 USP17L18D6R9N7 530 aa10.42□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 USP17L22D6RA61 530 aa10.42□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 USP17L17D6RBQ6 530 aa10.42□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 USP17L19D6RCP7 530 aa10.42□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 USP17L20D6RJB6 530 aa10.42□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 USP17L24Q0WX57 530 aa10.42□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 LHX6Q9UPM6 363 aa10.42□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa10.41□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 FBXO45P0C2W1 286 aa10.41□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 TCF3P15923 654 aa10.41□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 DOK7Q18PE1 504 aa10.41□□□□□ -0.74
AC008073.2-201ENST00000428344 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.8 ms