RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLEKHG3A1L390 1219 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-552P-201ENST00000362869 C6orf229H3BNL8 230 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-552P-201ENST00000362869 GJA5P36382 358 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-552P-201ENST00000362869 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPTLC1O15269 473 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-552P-201ENST00000362869 MSS51Q4VC12 460 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-552P-201ENST00000362869 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-552P-201ENST00000362869 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTMR2Q13614 643 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-552P-201ENST00000362869 SH3D19Q5HYK7 790 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-552P-201ENST00000362869 RETREG3Q86VR2 466 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF223E7ERA6 249 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL27Q8NEV9 243 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBTB3Q9H5J0 574 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPDYE5A6NIY4 337 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 HRCP23327 699 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 CABLES1Q8TDN4 633 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 RGS20O76081 388 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 MMP16P51512 607 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 QPCTQ16769 361 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 JUNDP17535 347 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRR7Q8TB68 274 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 GOPCQ9HD26 462 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 LILRB3O75022 631 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 CFAP99D6REC4 459 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSC1Q92574 1164 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.02□□□□□ -1.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 DESI1Q6ICB0 168 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTPRNQ16849 979 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC24Q8N4L8 307 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUDT12Q9BQG2 462 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 V9GY48 417 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC19A1P41440 591 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 LYPD8Q6UX82 237 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-552P-201ENST00000362869 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPIAP49247 311 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPRYD7Q5W111 196 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-552P-201ENST00000362869 RFC5P40937 340 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM32Q13049 653 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-552P-201ENST00000362869 AP1G2O75843 785 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RNU6-552P-201ENST00000362869 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTHP32929 405 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNH2Q12809 1159 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF697Q5TEC3 545 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RNU6-552P-201ENST00000362869 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAP10Q9P2G4 905 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
RNU6-552P-201ENST00000362869 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP17L8P0C7I0 530 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-552P-201ENST00000362869 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 WNT7BP56706 349 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC01559Q495D7 138 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNFRSF10AO00220 468 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 SKOR1P84550 965 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOXC1Q12948 553 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 WNT7AO00755 349 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 GDF9O60383 454 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRR20EP86478 221 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRR20CP86479 221 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRR20DP86480 221 aa6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.2 ms