RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC61Q9Y6R9 512 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 MAGI2Q86UL8 1455 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 KDM5CP41229 1560 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 KIF13AQ9H1H9 1805 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 NGEFQ8N5V2 710 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 BTG4Q9NY30 223 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 APBA3O96018 575 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 TEFQ10587 303 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 TATP17735 454 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 TTC5Q8N0Z6 440 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 PTPRMP28827 1452 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 ABCA6Q8N139 1617 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 GGNBP2Q9H3C7 697 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 RIMS2Q9UQ26 1411 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 KDM5DQ9BY66 1539 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 DDB1Q16531 1140 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 STAC3Q96MF2 364 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 POLD1P28340 1107 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 GPR162Q16538 588 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 RICTORQ6R327 1708 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 UNC13BO14795 1591 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 ACSBG1Q96GR2 724 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 AFF2P51816 1311 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 FAM177BA6PVY3 158 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 FAM9BQ8IZU0 186 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA2Q08379 1002 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 STK32BQ9NY57 414 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 NPATQ14207 1427 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 IQGAP3Q86VI3 1631 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 FAM182BQ5T319 152 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 KCNH5Q8NCM2 988 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 NBPF1Q3BBV0 1214 aa5.84□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 PLA2R1Q13018 1463 aa5.84□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM2Q9UHN6 1383 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 WASLO00401 505 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 ABCC3O15438 1527 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 TET3O43151 1660 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 PHF14O94880 888 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 NEFLP07196 543 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 KRT27Q7Z3Y8 459 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 CFAP44Q96MT7 982 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM37O94972 964 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 BICDL1Q6ZP65 573 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 PTPRTO14522 1441 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 EFCAB6Q5THR3 1501 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 CEP152O94986 1710 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 SEPT12Q8IYM1 358 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 AK7Q96M32 723 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 UGGT1Q9NYU2 1555 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 USP47Q96K76 1375 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 CGNL1Q0VF96 1302 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 CABP4P57796 275 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 E9PCH4 1651 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 AGLP35573 1532 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 MRS2Q9HD23 443 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 SPG7Q9UQ90 795 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 CHMP3Q9Y3E7 222 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 DEPDC5O75140 1603 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 MROH1Q8NDA8 1641 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 TRPM2O94759 1503 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 LMTK2Q8IWU2 1503 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 NOS1P29475 1434 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 ACEP12821 1306 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 JCADQ9P266 1359 aa5.8□□□□□ -1.48
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