RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.26■□□□□ 0.99
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
TRPC1-201ENST00000273482 NOS1P29475 1434 aa21.26■□□□□ 0.99
TRPC1-201ENST00000273482 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.25■□□□□ 0.99
TRPC1-201ENST00000273482 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
TRPC1-201ENST00000273482 STK31Q9BXU1 1019 aa21.25■□□□□ 0.99
TRPC1-201ENST00000273482 NGEFQ8N5V2 710 aa21.24■□□□□ 0.99
TRPC1-201ENST00000273482 CFAP44Q96MT7 982 aa21.23■□□□□ 0.99
TRPC1-201ENST00000273482 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.23■□□□□ 0.99
TRPC1-201ENST00000273482 BCAR3O75815 825 aa21.23■□□□□ 0.99
TRPC1-201ENST00000273482 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.22■□□□□ 0.99
TRPC1-201ENST00000273482 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
TRPC1-201ENST00000273482 A2MP01023 1474 aa21.22■□□□□ 0.99
TRPC1-201ENST00000273482 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.21■□□□□ 0.99
TRPC1-201ENST00000273482 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
TRPC1-201ENST00000273482 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.21■□□□□ 0.99
TRPC1-201ENST00000273482 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.2■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 MRE11P49959 708 aa21.2■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.2■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 TRAK2O60296 914 aa21.19■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 PZPP20742 1482 aa21.19■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.19■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 ABTB2Q8N961 1025 aa21.19■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 NECTIN2Q92692 538 aa21.19■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.18■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 PRKAR2BP31323 418 aa21.18■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.16■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.16■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.16■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 PDE3AQ14432 1141 aa21.16■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 ATF3P18847 181 aa21.15■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.15■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.15■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 MCCP23508 829 aa21.15■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.15■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.14■□□□□ 0.98
TRPC1-201ENST00000273482 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.13■□□□□ 0.97
TRPC1-201ENST00000273482 TEFQ10587 303 aa21.13■□□□□ 0.97
TRPC1-201ENST00000273482 AAMPQ13685 434 aa21.11■□□□□ 0.97
TRPC1-201ENST00000273482 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
TRPC1-201ENST00000273482 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.11■□□□□ 0.97
TRPC1-201ENST00000273482 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
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TRPC1-201ENST00000273482 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.1■□□□□ 0.97
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TRPC1-201ENST00000273482 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
TRPC1-201ENST00000273482 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.1■□□□□ 0.97
TRPC1-201ENST00000273482 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.1■□□□□ 0.97
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TRPC1-201ENST00000273482 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.08■□□□□ 0.97
TRPC1-201ENST00000273482 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.08■□□□□ 0.97
TRPC1-201ENST00000273482 ST18O60284 1047 aa21.08■□□□□ 0.96
TRPC1-201ENST00000273482 NPHP1O15259 732 aa21.07■□□□□ 0.96
TRPC1-201ENST00000273482 TESK2Q96S53 571 aa21.07■□□□□ 0.96
TRPC1-201ENST00000273482 FAM13BQ9NYF5 915 aa21.07■□□□□ 0.96
TRPC1-201ENST00000273482 MCM4P33991 863 aa21.07■□□□□ 0.96
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
TRPC1-201ENST00000273482 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.07■□□□□ 0.96
TRPC1-201ENST00000273482 ABCA8O94911 1581 aa21.06■□□□□ 0.96
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TRPC1-201ENST00000273482 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.06■□□□□ 0.96
TRPC1-201ENST00000273482 SLFN5Q08AF3 891 aa21.06■□□□□ 0.96
TRPC1-201ENST00000273482 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
TRPC1-201ENST00000273482 NME9Q86XW9 330 aa21.05■□□□□ 0.96
TRPC1-201ENST00000273482 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.05■□□□□ 0.96
TRPC1-201ENST00000273482 ADGRL2O95490 1459 aa21.05■□□□□ 0.96
TRPC1-201ENST00000273482 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
TRPC1-201ENST00000273482 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.05■□□□□ 0.96
TRPC1-201ENST00000273482 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
TRPC1-201ENST00000273482 EVA1CP58658 441 aa21.04■□□□□ 0.96
TRPC1-201ENST00000273482 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.04■□□□□ 0.96
TRPC1-201ENST00000273482 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.04■□□□□ 0.96
TRPC1-201ENST00000273482 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.03■□□□□ 0.96
TRPC1-201ENST00000273482 MBD5Q9P267 1494 aa21.03■□□□□ 0.96
TRPC1-201ENST00000273482 GNAI1P63096 354 aa21.03■□□□□ 0.96
TRPC1-201ENST00000273482 KCNJ4P48050 445 aa21.03■□□□□ 0.96
TRPC1-201ENST00000273482 NASPP49321 788 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.02■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 CHD1O14646 1710 aa21.01■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 DRC7Q8IY82 874 aa21■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 KDM6BO15054 1643 aa21■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 PKNOX2Q96KN3 472 aa21■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 GRPEL1Q9HAV7 217 aa21■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.99■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.99■□□□□ 0.95
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