RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.73■■□□□ 1.55
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ZBED3-201ENST00000255198 CALRP27797 417 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.72■■□□□ 1.55
ZBED3-201ENST00000255198 BRMS1Q9HCU9 246 aa24.72■■□□□ 1.55
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ZBED3-201ENST00000255198 NACADO15069 1562 aa24.72■■□□□ 1.55
ZBED3-201ENST00000255198 ERC2O15083 957 aa24.72■■□□□ 1.55
ZBED3-201ENST00000255198 CDR1P51861 262 aa24.72■■□□□ 1.55
ZBED3-201ENST00000255198 ROCK1Q13464 1354 aa24.71■■□□□ 1.55
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ZBED3-201ENST00000255198 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.69■■□□□ 1.54
ZBED3-201ENST00000255198 ATP2B1P20020 1258 aa24.69■■□□□ 1.54
ZBED3-201ENST00000255198 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.68■■□□□ 1.54
ZBED3-201ENST00000255198 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.68■■□□□ 1.54
ZBED3-201ENST00000255198 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
ZBED3-201ENST00000255198 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
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ZBED3-201ENST00000255198 CCDC173Q0VFZ6 552 aa24.64■■□□□ 1.53
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ZBED3-201ENST00000255198 FSD1Q9BTV5 496 aa24.63■■□□□ 1.53
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ZBED3-201ENST00000255198 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
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ZBED3-201ENST00000255198 NUCB2P80303 420 aa24.61■■□□□ 1.53
ZBED3-201ENST00000255198 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa24.6■■□□□ 1.53
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ZBED3-201ENST00000255198 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.6■■□□□ 1.53
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ZBED3-201ENST00000255198 PANK1Q8TE04 598 aa24.6■■□□□ 1.53
ZBED3-201ENST00000255198 GNAI1P63096 354 aa24.6■■□□□ 1.53
ZBED3-201ENST00000255198 JPH4Q96JJ6 628 aa24.6■■□□□ 1.53
ZBED3-201ENST00000255198 SMC2O95347 1197 aa24.59■■□□□ 1.53
ZBED3-201ENST00000255198 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
ZBED3-201ENST00000255198 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.59■■□□□ 1.53
ZBED3-201ENST00000255198 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
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ZBED3-201ENST00000255198 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.57■■□□□ 1.52
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ZBED3-201ENST00000255198 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.54■■□□□ 1.52
ZBED3-201ENST00000255198 CDC45O75419 566 aa24.54■■□□□ 1.52
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ZBED3-201ENST00000255198 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
ZBED3-201ENST00000255198 RDXP35241 583 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
ZBED3-201ENST00000255198 SYCP1Q15431 976 aa24.53■■□□□ 1.52
ZBED3-201ENST00000255198 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.53■■□□□ 1.52
ZBED3-201ENST00000255198 H0YHG0 523 aa24.53■■□□□ 1.52
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ZBED3-201ENST00000255198 DCTN1Q14203 1278 aa24.5■■□□□ 1.51
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ZBED3-201ENST00000255198 PLCD4Q9BRC7 762 aa24.5■■□□□ 1.51
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ZBED3-201ENST00000255198 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.49■■□□□ 1.51
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ZBED3-201ENST00000255198 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
ZBED3-201ENST00000255198 FILIP1LQ4L180 1135 aa24.46■■□□□ 1.51
ZBED3-201ENST00000255198 SMARCE1Q969G3 411 aa24.46■■□□□ 1.51
ZBED3-201ENST00000255198 KINO60870 393 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
ZBED3-201ENST00000255198 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
ZBED3-201ENST00000255198 TXLNAP40222 546 aa24.46■■□□□ 1.51
ZBED3-201ENST00000255198 STK3Q13188 491 aa24.46■■□□□ 1.51
ZBED3-201ENST00000255198 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
ZBED3-201ENST00000255198 PDCL3Q9H2J4 239 aa24.45■■□□□ 1.5
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