RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620030.1

PPP1CC-211, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 582 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-211ENST00000620030 HINFPQ9BQA5 517 aa24.96■■□□□ 1.59
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PPP1CC-211ENST00000620030 SMPD4Q9NXE4 827 aa24.96■■□□□ 1.59
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PPP1CC-211ENST00000620030 CFAP97Q9P2B7 532 aa24.94■■□□□ 1.58
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PPP1CC-211ENST00000620030 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
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PPP1CC-211ENST00000620030 FBXL13Q8NEE6 735 aa24.93■■□□□ 1.58
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PPP1CC-211ENST00000620030 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PPP1CC-211ENST00000620030 STX10O60499 249 aa24.92■■□□□ 1.58
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PPP1CC-211ENST00000620030 CD58P19256 250 aa24.92■■□□□ 1.58
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PPP1CC-211ENST00000620030 K7EQS6 105 aa24.88■■□□□ 1.57
PPP1CC-211ENST00000620030 CD44P16070 742 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
PPP1CC-211ENST00000620030 PXNP49023 591 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF394Q53GI3 561 aa24.88■■□□□ 1.57
PPP1CC-211ENST00000620030 ISM2Q6H9L7 571 aa24.88■■□□□ 1.57
PPP1CC-211ENST00000620030 PRR23BQ6ZRT6 265 aa24.88■■□□□ 1.57
PPP1CC-211ENST00000620030 SYT13Q7L8C5 426 aa24.88■■□□□ 1.57
PPP1CC-211ENST00000620030 TTC39CQ8N584 583 aa24.88■■□□□ 1.57
PPP1CC-211ENST00000620030 CAMKK1Q8N5S9 505 aa24.88■■□□□ 1.57
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