RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SNX30Q5VWJ9 437 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TAPT1Q6NXT6 567 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TAF2Q6P1X5 1199 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MPZL3Q6UWV2 235 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CPLX4Q7Z7G2 160 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GALNT4Q8N4A0 578 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PSD4Q8NDX1 1056 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RABGGTAQ92696 567 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNN1Q92952 543 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MCRS1Q96EZ8 462 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 APOPT1Q96IL0 206 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TCF25Q9BQ70 676 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TTPALQ9BTX7 342 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MECRQ9BV79 373 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDCL3Q9H2J4 239 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 USP22Q9UPT9 525 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HDAC5Q9UQL6 1122 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NR2E1Q9Y466 385 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 H3BNC9 293 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DHHO43323 396 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CYP21A2P08686 494 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VDRP11473 427 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HK1P19367 917 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNA3P22001 575 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HOXD13P35453 343 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GSK3AP49840 483 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LOXL3P58215 753 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PIGFQ07326 219 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLFN5Q08AF3 891 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNMA1Q12791 1236 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CSHL1Q14406 222 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF151Q2KHN1 245 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RILPL1Q5EBL4 403 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANO7Q6IWH7 933 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MFSD5Q6N075 450 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EFCAB12Q6NXP0 572 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRC8DQ7L1W4 858 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZSWIM9Q86XI8 627 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TTC30BQ8N4P2 665 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM171Q8WVE6 324 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DIRC2Q96SL1 478 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MCOLN1Q9GZU1 580 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 USP44Q9H0E7 712 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMOC2Q9H3U7 446 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CXorf36Q9H7Y0 433 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNK12Q9HB15 430 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLEKHA2Q9HB19 425 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 POGKQ9P215 609 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A1W2PRX2 142 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC78A2IDD5 438 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FURINP09958 794 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACADMP11310 421 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TGM1P22735 817 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MCM2P49736 904 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PGDP52209 483 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RIN1Q13671 783 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CSRP2Q16527 193 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NFIL3Q16649 462 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF568Q3ZCX4 644 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRC24Q50LG9 513 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MCTP2Q6DN12 878 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM108Q6UXF1 575 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRABD2AQ86V40 505 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LINS1Q8NG48 757 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CREB3L4Q8TEY5 395 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CUL5Q93034 780 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIM5Q9C035 493 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IL21RQ9HBE5 538 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VPS51Q9UID3 782 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADAM29Q9UKF5 820 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DRGXA6NNA5 263 aa5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105 ms