RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SUPT7LO94864 414 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MT-CO1P00395 513 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FGRP09769 529 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF484Q5JVG2 852 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAJC18Q9H819 358 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNMB3Q9NPA1 279 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AP3B1O00203 1094 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PJA2O43164 708 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNA3P22001 575 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VCPP55072 806 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BTNL9Q6UXG8 535 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPS8L1Q8TE68 723 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EDEM1Q92611 657 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSPAN17Q96FV3 270 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCLK3Q9C098 648 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ELK3P41970 407 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FUT2Q10981 343 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DENND1BQ6P3S1 775 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PBXIP1Q96AQ6 731 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PKP3Q9Y446 797 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SDR42E2A6NKP2 422 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNK1O00180 336 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BGNP21810 368 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GCNT1Q02742 428 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADGRF2Q8IZF7 708 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLITRK1Q96PX8 696 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WDR18Q9BV38 432 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUDT2P50583 147 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APOL5Q9BWW9 433 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD274Q9NZQ7 290 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDHGB4Q9UN71 923 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC37A3O60309 1634 aa17.17■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MTSS1O43312 755 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RCN1Q15293 331 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL31RAQ8NI17 732 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADAM32Q8TC27 787 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CPA4Q9UI42 421 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIAA1257Q9ULG3 409 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDYLQ9Y232 598 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIAS1O75925 651 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MARCKSL1P49006 195 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BCAT1P54687 386 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AQP5P55064 265 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM154Q6P9G4 183 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIRREL3Q8IZU9 778 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BTKQ06187 659 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IRF2BP1Q8IU81 584 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MFN1Q8IWA4 741 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SAMD3Q8N6K7 520 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCUN1D1Q96GG9 259 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPR63Q9BZJ6 419 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADNPQ9H2P0 1102 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RGPD2P0DJD1 1756 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C17orf102A2RUQ5 167 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CASTOR2A6NHX0 329 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF197O14709 1029 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSMD3O43242 534 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DGKZQ13574 1117 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBXO47Q5MNV8 452 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC26A11Q86WA9 606 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GLT1D1Q96MS3 346 aa17.16■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSMD10O75832 226 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NQO1P15559 274 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIST1H2ADP20671 130 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COPAP53621 1224 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ECM1Q16610 540 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CALML6Q8TD86 181 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BAP1Q92560 729 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WNK4Q96J92 1243 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAGEB18Q96M61 343 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIST1H2AJQ99878 128 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H2AFJQ9BTM1 129 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIF17Q9P2E2 1029 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIK3CDO00329 1044 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ASMTLO95671 621 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LSM8O95777 96 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SERPINB5P36952 375 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CPT1AP50416 773 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDK2Q15119 407 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms