RNA–Protein interactions for RNA: YKR071C

DRE2, Transcript of Component of the cytosolic Fe-S protein assembly (CIA) machinery, yeast

Gene DRE2, Length 1,047 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DRE2	YKR071C	YEL067C	P39978	195 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DRE2	YKR071C	YPL073C	P40323	161 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DRE2	YKR071C	TOS6	P48560	102 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DRE2	YKR071C	YML079W	Q03629	201 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DRE2	YKR071C	YLR296W	Q05898	108 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DRE2	YKR071C	YDR010C	Q12426	110 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DRE2	YKR071C	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DRE2	YKR071C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
DRE2	YKR071C	YNR077C	P53758	84 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DRE2	YKR071C	PAI3	P01094	68 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DRE2	YKR071C	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DRE2	YKR071C	AIM29	P36154	155 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DRE2	YKR071C	AIM19	P40502	157 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DRE2	YKR071C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DRE2	YKR071C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
DRE2	YKR071C	PEX22	P39718	180 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRE2	YKR071C	RPC10	P40422	70 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRE2	YKR071C	ELC1	Q03071	99 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRE2	YKR071C	RUB1	Q03919	77 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRE2	YKR071C	YPL261C	Q08976	102 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRE2	YKR071C	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRE2	YKR071C	ENV10	Q99382	181 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRE2	YKR071C	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
DRE2	YKR071C	YKR041W	P36134	250 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DRE2	YKR071C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DRE2	YKR071C	YBR219C	P38317	127 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DRE2	YKR071C	YFR057W	P43625	151 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DRE2	YKR071C	EOS1	P53938	366 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DRE2	YKR071C	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DRE2	YKR071C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
DRE2	YKR071C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DRE2	YKR071C	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
DRE2	YKR071C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
DRE2	YKR071C	OXA1	P39952	402 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DRE2	YKR071C	YJR146W	P47174	117 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DRE2	YKR071C	AIM11	P87275	137 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DRE2	YKR071C	YEL008W	P40001	126 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DRE2	YKR071C	YER181C	P40097	107 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DRE2	YKR071C	ECM12	O13529	151 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DRE2	YKR071C	TRP1	P00912	224 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DRE2	YKR071C	ATP15	P21306	62 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DRE2	YKR071C	MRPS12	P53732	153 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DRE2	YKR071C	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DRE2	YKR071C	IGO2	Q9P305	131 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DRE2	YKR071C	YAR029W	P39549	74 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DRE2	YKR071C	YPL257W	Q08974	193 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DRE2	YKR071C	CWP2	P43497	92 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DRE2	YKR071C	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DRE2	YKR071C	SLO1	Q3E784	85 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DRE2	YKR071C	POP7	P38291	140 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DRE2	YKR071C	YMR295C	Q03559	197 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DRE2	YKR071C	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DRE2	YKR071C	UGX2	P32772	223 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DRE2	YKR071C	YGL149W	P53116	101 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DRE2	YKR071C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
DRE2	YKR071C	YNL190W	P53872	204 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DRE2	YKR071C	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
DRE2	YKR071C	MID2	P36027	376 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DRE2	YKR071C	PEX17	P40155	199 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DRE2	YKR071C	YAL065C	O13511	128 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DRE2	YKR071C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
DRE2	YKR071C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
DRE2	YKR071C	SHU1	P38751	150 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DRE2	YKR071C	OST2	P46964	130 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DRE2	YKR071C	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DRE2	YKR071C	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DRE2	YKR071C	AQY2	P0CD90	149 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DRE2	YKR071C	HPA2	Q06592	156 aa		4.02	□□□□□ -1.77
DRE2	YKR071C	YLR156W	P0CE96	114 aa		4	□□□□□ -1.77
DRE2	YKR071C	YLR159W	P0CE97	114 aa		4	□□□□□ -1.77
DRE2	YKR071C	YLR161W	P0CE98	114 aa		4	□□□□□ -1.77
DRE2	YKR071C	ATX1	P38636	73 aa		4	□□□□□ -1.77
DRE2	YKR071C	QCR8	P08525	94 aa		3.99	□□□□□ -1.77
DRE2	YKR071C	COX10	P21592	462 aa		3.99	□□□□□ -1.77
DRE2	YKR071C	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
DRE2	YKR071C	YIA6	P40556	373 aa		3.99	□□□□□ -1.77
DRE2	YKR071C	YDL241W	Q07738	123 aa		3.99	□□□□□ -1.77
DRE2	YKR071C	INO4	P13902	151 aa		3.98	□□□□□ -1.77
DRE2	YKR071C	YFL019C	P43576	117 aa		3.98	□□□□□ -1.77
DRE2	YKR071C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
DRE2	YKR071C	PPT2	Q12036	173 aa		3.98	□□□□□ -1.77
DRE2	YKR071C	YHR130C	P38834	111 aa		3.97	□□□□□ -1.77
DRE2	YKR071C	DSE2	P38844	325 aa		3.97	□□□□□ -1.77
DRE2	YKR071C	YOR268C	Q08734	132 aa		3.97	□□□□□ -1.77
DRE2	YKR071C	ISD11	Q6Q560	94 aa		3.97	□□□□□ -1.77
DRE2	YKR071C	COX14	P39103	70 aa		3.96	□□□□□ -1.78
DRE2	YKR071C	UBC4	P15731	148 aa		3.95	□□□□□ -1.78
DRE2	YKR071C	YFL065C	P43539	102 aa		3.95	□□□□□ -1.78
DRE2	YKR071C	IGD1	P43598	195 aa		3.95	□□□□□ -1.78
DRE2	YKR071C	YGL193C	P53097	103 aa		3.95	□□□□□ -1.78
DRE2	YKR071C	RGM1	Q00453	211 aa		3.95	□□□□□ -1.78
DRE2	YKR071C	YPR203W	Q08994	102 aa		3.95	□□□□□ -1.78
DRE2	YKR071C	TOA2	P32774	122 aa		3.94	□□□□□ -1.78
DRE2	YKR071C	KNH1	P50112	268 aa		3.94	□□□□□ -1.78
DRE2	YKR071C	ABF2	Q02486	183 aa		3.94	□□□□□ -1.78
DRE2	YKR071C	STF1	P01098	86 aa		3.93	□□□□□ -1.78
DRE2	YKR071C	YBL039W-B	P0C268	59 aa		3.93	□□□□□ -1.78
DRE2	YKR071C	MVB12	P42939	101 aa		3.93	□□□□□ -1.78
DRE2	YKR071C	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		3.93	□□□□□ -1.78
DRE2	YKR071C	KRE1	P17260	313 aa		3.92	□□□□□ -1.78

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 54.7 ms