RNA–Protein interactions for RNA: YHR108W

GGA2, Transcript of Protein that regulates Arf1p, Arf2p to facilitate Golgi trafficking, yeast

Gene GGA2, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GGA2	YHR108W	ERG28	P40030	148 aa		5.98	□□□□□ -1.45
GGA2	YHR108W	YIA6	P40556	373 aa		5.98	□□□□□ -1.45
GGA2	YHR108W	CWP2	P43497	92 aa		5.98	□□□□□ -1.45
GGA2	YHR108W	SLO1	Q3E784	85 aa		5.98	□□□□□ -1.45
GGA2	YHR108W	RPR2	P40571	144 aa		5.98	□□□□□ -1.45
GGA2	YHR108W	HPA2	Q06592	156 aa		5.98	□□□□□ -1.45
GGA2	YHR108W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		5.96	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	EOS1	P53938	366 aa		5.96	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		5.95	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	COX10	P21592	462 aa		5.95	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	HAL1	Q01766	294 aa		5.95	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	YLR122C	Q12312	125 aa		5.95	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		5.95	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	ATX1	P38636	73 aa		5.94	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	RGM1	Q00453	211 aa		5.94	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	OST2	P46964	130 aa		5.93	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	SPC1	P46965	94 aa		5.93	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	UBC11	P52492	156 aa		5.93	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.93	□□□□□ -1.46	not detected
GGA2	YHR108W	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		5.93	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	YMR320W	Q04897	101 aa		5.93	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	YAL065C	O13511	128 aa		5.92	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	HUR1	P45820	110 aa		5.92	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		5.92	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	RPC10	P40422	70 aa		5.91	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	ABF2	Q02486	183 aa		5.91	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	YDL241W	Q07738	123 aa		5.91	□□□□□ -1.46
GGA2	YHR108W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
GGA2	YHR108W	DSE2	P38844	325 aa		5.89	□□□□□ -1.47
GGA2	YHR108W	SVP26	P38869	228 aa		5.87	□□□□□ -1.47
GGA2	YHR108W	YAL064W	P39711	94 aa		5.87	□□□□□ -1.47
GGA2	YHR108W	INO4	P13902	151 aa		5.86	□□□□□ -1.47
GGA2	YHR108W	AIM19	P40502	157 aa		5.86	□□□□□ -1.47
GGA2	YHR108W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
GGA2	YHR108W	YPL229W	Q99395	206 aa		5.86	□□□□□ -1.47
GGA2	YHR108W	DIF1	O13577	133 aa		5.85	□□□□□ -1.47
GGA2	YHR108W	KNH1	P50112	268 aa		5.85	□□□□□ -1.47
GGA2	YHR108W	PBA1	Q05778	276 aa		5.85	□□□□□ -1.47
GGA2	YHR108W	RTC6	O14464	93 aa		5.85	□□□□□ -1.47
GGA2	YHR108W	SOH1	P38633	127 aa		5.85	□□□□□ -1.47
GGA2	YHR108W	MVB12	P42939	101 aa		5.85	□□□□□ -1.47
GGA2	YHR108W	YDR115W	Q04598	105 aa		5.85	□□□□□ -1.47
GGA2	YHR108W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		5.85	□□□□□ -1.47
GGA2	YHR108W	AQY2	P0CD90	149 aa		5.84	□□□□□ -1.47
GGA2	YHR108W	YCR085W	P25650	117 aa		5.84	□□□□□ -1.47
GGA2	YHR108W	IRC21	Q04772	201 aa		5.84	□□□□□ -1.47
GGA2	YHR108W	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
GGA2	YHR108W	AUA1	P32450	94 aa		5.83	□□□□□ -1.48
GGA2	YHR108W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
GGA2	YHR108W	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		5.83	□□□□□ -1.48
GGA2	YHR108W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		5.82	□□□□□ -1.48
GGA2	YHR108W	YBL039W-B	P0C268	59 aa		5.82	□□□□□ -1.48
GGA2	YHR108W	YFL019C	P43576	117 aa		5.82	□□□□□ -1.48
GGA2	YHR108W	ICY1	Q04329	127 aa		5.82	□□□□□ -1.48
GGA2	YHR108W	MSA2	P36157	363 aa		5.8	□□□□□ -1.48
GGA2	YHR108W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.8	□□□□□ -1.48	not detected
GGA2	YHR108W	RRT15	Q3E811	62 aa		5.8	□□□□□ -1.48
GGA2	YHR108W	ISD11	Q6Q560	94 aa		5.8	□□□□□ -1.48
GGA2	YHR108W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
GGA2	YHR108W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GGA2	YHR108W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
GGA2	YHR108W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
GGA2	YHR108W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
GGA2	YHR108W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
GGA2	YHR108W	YFL065C	P43539	102 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GGA2	YHR108W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
GGA2	YHR108W	YPR203W	Q08994	102 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GGA2	YHR108W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
GGA2	YHR108W	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GGA2	YHR108W	MPC3	P53311	146 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GGA2	YHR108W	UBC4	P15731	148 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GGA2	YHR108W	SNA2	P56508	79 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GGA2	YHR108W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GGA2	YHR108W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GGA2	YHR108W	STF1	P01098	86 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GGA2	YHR108W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GGA2	YHR108W	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		5.72	□□□□□ -1.49
GGA2	YHR108W	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		5.72	□□□□□ -1.49
GGA2	YHR108W	DYN1	P36022	4092 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GGA2	YHR108W	IGD1	P43598	195 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GGA2	YHR108W	TSC3	Q3E790	80 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GGA2	YHR108W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		5.7	□□□□□ -1.5
GGA2	YHR108W	KRE1	P17260	313 aa		5.7	□□□□□ -1.5
GGA2	YHR108W	ATP18	P81450	59 aa		5.7	□□□□□ -1.5
GGA2	YHR108W	FYV5	P25585	152 aa		5.69	□□□□□ -1.5
GGA2	YHR108W	SMP1	P38128	452 aa		5.69	□□□□□ -1.5
GGA2	YHR108W	YBR230W-A	Q3E762	66 aa		5.69	□□□□□ -1.5
GGA2	YHR108W	YHR139C-A	O13536	103 aa		5.67	□□□□□ -1.5
GGA2	YHR108W	YDR029W	Q12111	104 aa		5.67	□□□□□ -1.5
GGA2	YHR108W	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		5.67	□□□□□ -1.5
GGA2	YHR108W	SFT1	P43682	97 aa		5.67	□□□□□ -1.5
GGA2	YHR108W	EMC6	Q12431	108 aa		5.67	□□□□□ -1.5
GGA2	YHR108W	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		5.67	□□□□□ -1.5
GGA2	YHR108W	ECM12	O13529	151 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GGA2	YHR108W	RAD6	P06104	172 aa		5.65	□□□□□ -1.5
GGA2	YHR108W	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		5.65	□□□□□ -1.5

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