RNA–Protein interactions for RNA: YHR014W

SPO13, Transcript of Meiotic regulator, yeast

Gene SPO13, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPO13	YHR014W	YHL005C	P38752	130 aa		0.1	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	YER181C	P40097	107 aa		0.1	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	EST3	Q03096	181 aa		0.1	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	IRC21	Q04772	201 aa		0.1	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		0.1	□□□□□ -2.39
SPO13	YHR014W	COX7	P10174	60 aa		0.09	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	PET54	P10834	293 aa		0.09	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	SPI1	P40092	148 aa		0.09	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	RPC10	P40422	70 aa		0.09	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	SPG1	P50088	95 aa		0.09	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	BRP1	P53194	125 aa		0.09	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	YGR042W	P53227	271 aa		0.09	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	PMP3	P87284	55 aa		0.09	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	YDR366C	P87287	132 aa		0.09	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	YMR122C	Q03879	124 aa		0.09	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	SDH7	Q04401	133 aa		0.09	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	FRQ1	Q06389	190 aa		0.09	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		0.09	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		0.09	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	SCS22	Q6Q595	175 aa		0.09	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		0.09	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	SFT2	P38166	215 aa		0.08	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	YBR016W	P38216	128 aa		0.08	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	HPM1	P40481	377 aa		0.08	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	PAM16	P42949	149 aa		0.08	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	YNL019C	P53975	284 aa		0.08	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	MAK3	Q03503	176 aa		0.08	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	0.08	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		0.08	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		0.08	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	YGL204C	P53089	101 aa		0.07	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	ATP19	P81451	68 aa		0.07	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	NSL1	Q12143	216 aa		0.07	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	MRP49	P32388	137 aa		0.06	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	YCL001W-A	P87012	153 aa		0.06	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	PCC1	Q3E833	88 aa		0.06	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	ENV10	Q99382	181 aa		0.06	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	COX9	P07255	59 aa		0.05	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	YHR073W-A	P0C5N7	58 aa		0.05	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		0.05	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	YBR032W	P38223	100 aa		0.05	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	PAU12	P53343	120 aa		0.05	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	YDR042C	Q03205	200 aa		0.05	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		0.05	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		0.05	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	QCR2	P07257	368 aa		0.04	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	HAP3	P13434	144 aa		0.04	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	FYV5	P25585	152 aa		0.04	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	PAU2	P32612	120 aa		0.04	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	PAU24	P38155	120 aa		0.04	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	YLR118C	Q12354	227 aa		0.04	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		0.04	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	COA6	Q3E846	104 aa		0.04	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	DDR2	P89113	61 aa		0.03	□□□□□ -2.4
SPO13	YHR014W	YAL065C	O13511	128 aa		0.02	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	YBL039W-B	P0C268	59 aa		0.02	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	MRP17	P28778	131 aa		0.02	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	FPR2	P32472	135 aa		0.02	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	0.02	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	MIC27	P50945	234 aa		0.02	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	BSC4	P53841	131 aa		0.02	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		0.02	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	PAU19	P0CE85	124 aa		0.01	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	PAU21	P0CE86	164 aa		0.01	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	PAU22	P0CE87	164 aa		0.01	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	0.01	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	PAU3	P25610	124 aa		0.01	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	SHU1	P38751	150 aa		0.01	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	0.01	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	PAU15	P40585	124 aa		0.01	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	SCP1	Q08873	200 aa		0.01	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		0.01	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		0.01	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	PET20	Q99373	253 aa		0.01	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	0	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	0	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	0	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	AME1	P38313	324 aa		0	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	YER187W	P40102	141 aa		0	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	YML054C-A	Q3E809	52 aa		0	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	PAU16	P35994	123 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	YAR029W	P39549	74 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	SWM2	P40342	146 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	TLG1	Q03322	224 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	SPC2	Q04969	178 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	DAD1	Q12248	94 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	COA2	Q3E823	68 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	FUN14	P18411	198 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	-0.02	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	TVP18	Q04767	167 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
SPO13	YHR014W	SOM1	Q05676	74 aa		-0.02	□□□□□ -2.41

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