RNA–Protein interactions for RNA: YHL004W

MRP4, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRP4, Length 1,185 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP4	YHL004W	YHR022C	P38763	256 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRP4	YHL004W	GPI19	Q04082	140 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRP4	YHL004W	PRM7	Q12459	698 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRP4	YHL004W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	YGR025W	P53216	100 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	LIP1	Q03579	150 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	TVP18	Q04767	167 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	PAU16	P35994	123 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.12	□□□□□ -1.91	not detected
MRP4	YHL004W	GAT4	P40569	121 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	ERV14	P53173	138 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	BRP1	P53194	125 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	YGR164W	P53291	111 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	FUN14	P18411	198 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	COX10	P21592	462 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	MIG1	P27705	504 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	YKR032W	P36127	104 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	SEN15	Q04675	128 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	YOL085C	Q99345	113 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	PFY1	P07274	126 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	UBC5	P15732	148 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	MGR2	Q02889	113 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	YLR042C	Q07990	161 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	FYV12	Q08559	129 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	MRPL44	P19956	98 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	COX12	Q01519	83 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	ATP20	Q12233	115 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MRP4	YHL004W	DCV1	P43595	202 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	TOS6	P48560	102 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	HAL1	Q01766	294 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	YDR042C	Q03205	200 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	SCM4	P32564	187 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	DYN1	P36022	4092 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	KRE9	P39005	276 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	YNL217W	P40152	326 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	YFR035C	P43608	114 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	PMP3	P87284	55 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	VAM10	Q08474	114 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	HAP3	P13434	144 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	SEC11	P15367	167 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	YCR050C	P25630	102 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	YKL044W	P36092	106 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	YAR029W	P39549	74 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	SGF11	Q03067	99 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	YMR103C	Q04436	120 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	HMRA2	P0CY13	119 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	YCR001W	P25347	104 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	NAT5	Q08689	176 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	YDL157C	Q12082	118 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	SCS22	Q6Q595	175 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	YJR146W	P47174	117 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	MPC3	P53311	146 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	YML079W	Q03629	201 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	PAU23	Q07987	124 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	PAU17	Q12370	124 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	COA3	Q3E7B2	85 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MRP4	YHL004W	MID2	P36027	376 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MRP4	YHL004W	NRG2	P38082	220 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MRP4	YHL004W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
MRP4	YHL004W	YPL261C	Q08976	102 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MRP4	YHL004W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MRP4	YHL004W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		3	□□□□□ -1.93
MRP4	YHL004W	YBR209W	P38311	105 aa		3	□□□□□ -1.93
MRP4	YHL004W	YAL064W	P39711	94 aa		3	□□□□□ -1.93
MRP4	YHL004W	YIL059C	P40520	121 aa		3	□□□□□ -1.93
MRP4	YHL004W	SPC1	P46965	94 aa		3	□□□□□ -1.93
MRP4	YHL004W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
MRP4	YHL004W	YOR268C	Q08734	132 aa		3	□□□□□ -1.93
MRP4	YHL004W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		3	□□□□□ -1.93
MRP4	YHL004W	YEL008W	P40001	126 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MRP4	YHL004W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MRP4	YHL004W	YNR077C	P53758	84 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MRP4	YHL004W	YLR194C	Q05777	254 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MRP4	YHL004W	ENV10	Q99382	181 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MRP4	YHL004W	QCR8	P08525	94 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MRP4	YHL004W	AUA1	P32450	94 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MRP4	YHL004W	SHU1	P38751	150 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MRP4	YHL004W	TDA2	P40045	126 aa		2.97	□□□□□ -1.93

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