RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C YKR041WP36134 250 aa1.49□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C COX14P39103 70 aa1.49□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data1.49□□□□□ -2.17not detected
GCN4YEL009C YPL073CP40323 161 aa1.49□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C GAT4P40569 121 aa1.49□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C CIN5P40917 295 aa1.49□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C LSM8P47093 109 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C MRPS12P53732 153 aa1.49□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C LCL2Q08045 131 aa1.49□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C NAT5Q08689 176 aa1.49□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C YDL157CQ12082 118 aa1.49□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C FYV7Q12247 151 aa1.49□□□□□ -2.17
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GCN4YEL009C ATP5P09457 212 aa1.48□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C SCM4P32564 187 aa1.48□□□□□ -2.17
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GCN4YEL009C SNA2P56508 79 aa1.48□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C YDL241WQ07738 123 aa1.48□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C YDR029WQ12111 104 aa1.48□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C IGO2Q9P305 131 aa1.48□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C QCR8P08525 94 aa1.47□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C AQY2P0CD90 149 aa1.47□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C HAP3P13434 144 aa1.47□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C UGX2P32772 223 aa1.47□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C OXA1P39952 402 aa1.47□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C YNL190WP53872 204 aa1.47□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C SAE3P89114 91 aa1.47□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C ABF2Q02486 183 aa1.47□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C PAU23Q07987 124 aa1.47□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C PAU17Q12370 124 aa1.47□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C YLL006W-AQ3E814 58 aa1.47□□□□□ -2.17
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GCN4YEL009C YBL039W-BP0C268 59 aa1.46□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C SMP1P38128 452 aa1.46□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C PEX22P39718 180 aa1.46□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C MVB12P42939 101 aa1.46□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C CWP2P43497 92 aa1.46□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C YFR057WP43625 151 aa1.46□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C YJR085CP47131 105 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
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GCN4YEL009C ECM12O13529 151 aa1.45□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C STF1P01098 86 aa1.45□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C YFL019CP43576 117 aa1.45□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C IGD1P43598 195 aa1.45□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C ELC1Q03071 99 aa1.45□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C YML079WQ03629 201 aa1.45□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C YLR363W-AQ3E747 85 aa1.45□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C YGL041C-BQ3E750 60 aa1.45□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C YLR307C-AQ3E825 87 aa1.45□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C Q0032Q9ZZX7 96 aa1.45□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C RPL29P05747 59 aaPredicted RBP1.44□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C YHR130CP38834 111 aa1.44□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C AIM19P40502 157 aa1.44□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C YIA6P40556 373 aa1.44□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C GLC8P41818 229 aa1.44□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C LCL1Q02786 101 aa1.44□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C HPA2Q06592 156 aa1.44□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C YKL023C-AQ2V2P3 75 aa1.44□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C YOR020W-AQ3E824 90 aa1.44□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C PAI3P01094 68 aa1.43□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C YER181CP40097 107 aa1.43□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C KNH1P50112 268 aa1.43□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C EOS1P53938 366 aa1.43□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C RGM1Q00453 211 aa1.43□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C CWC27Q02770 301 aa1.43□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C RPL26AP05743 127 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C UBC4P15731 148 aa1.42□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C COX10P21592 462 aa1.42□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C NHP2P32495 156 aaPredicted RBP1.42□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C POP7P38291 140 aa1.42□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C YGL193CP53097 103 aa1.42□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C MMS2P53152 137 aa1.42□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C RPL26BP53221 127 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C ICY1Q04329 127 aa1.42□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C IRC21Q04772 201 aa1.42□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C YLR296WQ05898 108 aa1.42□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C LSM6Q06406 86 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C YOR034C-AQ3E735 80 aa1.41□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C YBR230W-AQ3E762 66 aa1.41□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa1.41□□□□□ -2.18
GCN4YEL009C YPR170W-BP0C5R9 85 aa1.4□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C YER039C-AP0CD97 72 aa1.4□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C YLR156WP0CE96 114 aa1.4□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C YLR159WP0CE97 114 aa1.4□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C YLR161WP0CE98 114 aa1.4□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C DDR48P18899 430 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP1.4□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C YNL198CP40166 100 aa1.4□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C HUR1P45820 110 aa1.4□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C DDR2P89113 61 aa1.4□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C YPL257WQ08974 193 aa1.4□□□□□ -2.19
GCN4YEL009C YIL102C-AQ2V2P5 75 aa1.4□□□□□ -2.19
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