RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeastyeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNQ1YCL028W ELC1Q03071 99 aa7.79□□□□□ -1.16
RNQ1YCL028W YML079WQ03629 201 aa7.79□□□□□ -1.16
RNQ1YCL028W HAP3P13434 144 aa7.78□□□□□ -1.16
RNQ1YCL028W UGX2P32772 223 aa7.78□□□□□ -1.16
RNQ1YCL028W TOA2P32774 122 aa7.78□□□□□ -1.16
RNQ1YCL028W YNL190WP53872 204 aa7.78□□□□□ -1.16
RNQ1YCL028W YPR195CQ06594 109 aa7.78□□□□□ -1.16
RNQ1YCL028W VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data7.78□□□□□ -1.16not detected
RNQ1YCL028W CDC43P18898 376 aa7.76□□□□□ -1.17
RNQ1YCL028W CWC27Q02770 301 aa7.75□□□□□ -1.17
RNQ1YCL028W YDL241WQ07738 123 aa7.75□□□□□ -1.17
RNQ1YCL028W MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
RNQ1YCL028W MID2P36027 376 aa7.73□□□□□ -1.17
RNQ1YCL028W CWP2P43497 92 aa7.73□□□□□ -1.17
RNQ1YCL028W ANB1P19211 157 aa7.72□□□□□ -1.17
RNQ1YCL028W SNA2P56508 79 aa7.71□□□□□ -1.18
RNQ1YCL028W SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
RNQ1YCL028W ABF2Q02486 183 aa7.7□□□□□ -1.18
RNQ1YCL028W YLL006W-AQ3E814 58 aa7.7□□□□□ -1.18
RNQ1YCL028W AQY2P0CD90 149 aa7.69□□□□□ -1.18
RNQ1YCL028W MBF1O14467 151 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RNQ1YCL028W YER181CP40097 107 aa7.68□□□□□ -1.18
RNQ1YCL028W PAI3P01094 68 aa7.66□□□□□ -1.18
RNQ1YCL028W MVB12P42939 101 aa7.66□□□□□ -1.18
RNQ1YCL028W UBC11P52492 156 aa7.66□□□□□ -1.18
RNQ1YCL028W MHR1Q06630 226 aa7.66□□□□□ -1.18
RNQ1YCL028W YDR034C-AP0C289 58 aa7.65□□□□□ -1.18
RNQ1YCL028W YIA6P40556 373 aa7.65□□□□□ -1.18
RNQ1YCL028W YDR029WQ12111 104 aa7.65□□□□□ -1.18
RNQ1YCL028W YLR296WQ05898 108 aa7.63□□□□□ -1.19
RNQ1YCL028W HPA2Q06592 156 aa7.63□□□□□ -1.19
RNQ1YCL028W UIP3P39547 235 aa7.62□□□□□ -1.19
RNQ1YCL028W YFL019CP43576 117 aa7.62□□□□□ -1.19
RNQ1YCL028W YKL023C-AQ2V2P3 75 aa7.62□□□□□ -1.19
RNQ1YCL028W YBL039W-BP0C268 59 aa7.61□□□□□ -1.19
RNQ1YCL028W YHR130CP38834 111 aa7.61□□□□□ -1.19
RNQ1YCL028W YOR020W-AQ3E824 90 aa7.61□□□□□ -1.19
RNQ1YCL028W YPL229WQ99395 206 aa7.61□□□□□ -1.19
RNQ1YCL028W NHP2P32495 156 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RNQ1YCL028W POP7P38291 140 aa7.59□□□□□ -1.19
RNQ1YCL028W EOS1P53938 366 aa7.59□□□□□ -1.19
RNQ1YCL028W RGM1Q00453 211 aa7.59□□□□□ -1.19
RNQ1YCL028W YIL102C-AQ2V2P5 75 aa7.59□□□□□ -1.19
RNQ1YCL028W YPR170W-BP0C5R9 85 aa7.58□□□□□ -1.2
RNQ1YCL028W CPR1P14832 162 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RNQ1YCL028W GAT4P40569 121 aa7.58□□□□□ -1.2
RNQ1YCL028W LSM6Q06406 86 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RNQ1YCL028W LCL2Q08045 131 aa7.58□□□□□ -1.2
RNQ1YCL028W STF1P01098 86 aa7.57□□□□□ -1.2
RNQ1YCL028W RPL29P05747 59 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RNQ1YCL028W ARO2P28777 376 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RNQ1YCL028W SMP1P38128 452 aa7.57□□□□□ -1.2
RNQ1YCL028W YGL041C-BQ3E750 60 aa7.57□□□□□ -1.2
RNQ1YCL028W Q0032Q9ZZX7 96 aa7.57□□□□□ -1.2
RNQ1YCL028W COX10P21592 462 aa7.56□□□□□ -1.2
RNQ1YCL028W PEX22P39718 180 aa7.56□□□□□ -1.2
RNQ1YCL028W AIM19P40502 157 aa7.56□□□□□ -1.2
RNQ1YCL028W ECM12O13529 151 aa7.55□□□□□ -1.2
RNQ1YCL028W KNH1P50112 268 aa7.55□□□□□ -1.2
RNQ1YCL028W YNL198CP40166 100 aa7.54□□□□□ -1.2
RNQ1YCL028W IGD1P43598 195 aa7.54□□□□□ -1.2
RNQ1YCL028W IRC21Q04772 201 aa7.52□□□□□ -1.21
RNQ1YCL028W TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RNQ1YCL028W UBC4P15731 148 aa7.49□□□□□ -1.21
RNQ1YCL028W ICY1Q04329 127 aa7.49□□□□□ -1.21
RNQ1YCL028W YOR034C-AQ3E735 80 aa7.49□□□□□ -1.21
RNQ1YCL028W HYP2P23301 157 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RNQ1YCL028W MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RNQ1YCL028W HUR1P45820 110 aa7.48□□□□□ -1.21
RNQ1YCL028W YNL162W-AQ3E7A8 72 aa7.48□□□□□ -1.21
RNQ1YCL028W RPL26AP05743 127 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RNQ1YCL028W RPL26BP53221 127 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RNQ1YCL028W YLR307C-AQ3E825 87 aa7.44□□□□□ -1.22
RNQ1YCL028W YGL193CP53097 103 aa7.41□□□□□ -1.22
RNQ1YCL028W LCL1Q02786 101 aa7.41□□□□□ -1.22
RNQ1YCL028W YLR236CA0A023PZG4 107 aa7.39□□□□□ -1.23
RNQ1YCL028W YBR230W-AQ3E762 66 aa7.39□□□□□ -1.23
RNQ1YCL028W YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa7.38□□□□□ -1.23
RNQ1YCL028W YJL127C-BQ3E828 52 aa7.38□□□□□ -1.23
RNQ1YCL028W YPL257WQ08974 193 aa7.37□□□□□ -1.23
RNQ1YCL028W FYV5P25585 152 aa7.36□□□□□ -1.23
RNQ1YCL028W MSA2P36157 363 aa7.36□□□□□ -1.23
RNQ1YCL028W MPC3P53311 146 aa7.36□□□□□ -1.23
RNQ1YCL028W GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data7.35□□□□□ -1.23not detected
RNQ1YCL028W YER039C-AP0CD97 72 aa7.34□□□□□ -1.23
RNQ1YCL028W DUT1P33317 147 aa7.34□□□□□ -1.23
RNQ1YCL028W DSE2P38844 325 aa7.34□□□□□ -1.23
RNQ1YCL028W MMS2P53152 137 aa7.33□□□□□ -1.24
RNQ1YCL028W DDR2P89113 61 aa7.33□□□□□ -1.24
RNQ1YCL028W YLR156WP0CE96 114 aa7.31□□□□□ -1.24
RNQ1YCL028W YLR159WP0CE97 114 aa7.31□□□□□ -1.24
RNQ1YCL028W YLR161WP0CE98 114 aa7.31□□□□□ -1.24
RNQ1YCL028W SPT4P32914 102 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RNQ1YCL028W YJR107C-AP0CT86 78 aa7.28□□□□□ -1.24
RNQ1YCL028W BET1P22804 142 aa7.27□□□□□ -1.25
RNQ1YCL028W SFT1P43682 97 aa7.26□□□□□ -1.25
RNQ1YCL028W BSC4P53841 131 aa7.25□□□□□ -1.25
RNQ1YCL028W YBL112CQ3E7Y4 105 aa7.24□□□□□ -1.25
RNQ1YCL028W RPA12P32529 125 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RNQ1YCL028W YHR007C-AQ07074 71 aa7.23□□□□□ -1.25
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