RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	GKN1	Q9NS71	199 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CISH	Q9NSE2	258 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	MYH10	P35580	1976 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	PI15	O43692	258 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ATG13	O75143	517 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CILP	O75339	1184 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	PRAMEF12	O95522	483 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC130	P13994	396 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CD19	P15391	556 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC5A3	P53794	718 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	NRL	P54845	237 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CUL2	Q13617	745 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	SGO2	Q562F6	1265 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	NCAN	O14594	1321 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	PMM2	O15305	246 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CD72	P21854	359 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	TUB	P50607	506 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CCR3	P51677	355 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC7A9	P82251	487 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ORC1	Q13415	861 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	STIL	Q15468	1287 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC142	Q17RM4	750 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	TTI2	Q6NXR4	508 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	FUK	Q8N0W3	1084 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	C12orf29	Q8N999	325 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	GOLGA1	Q92805	767 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC35C1	Q96A29	364 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNK16	Q96T55	309 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	DUSP16	Q9BY84	665 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	SDCBP2	Q9H190	292 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	EBF3	Q9H4W6	596 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	C2orf78	A6NCI8	922 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	TCF3	P15923	654 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CTH	P32929	405 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	USP46	P62068	366 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNH2	Q12809	1159 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	TCF15	Q12870	199 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	LRMP	Q12912	555 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXO43	Q4G163	708 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CBWD6	Q4V339	395 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	TTC8	Q8TAM2	541 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	SEMA4D	Q92854	862 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CCL26	Q9Y258	94 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CPQ	Q9Y646	472 aa		11.97	□□□□□ -0.49

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