RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461405.1

PHF20-208, Transcript of PHD finger protein 20, human

TSL 2

Gene PHF20, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20-208	ENST00000461405	STIL	Q15468	1287 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	TEAD2	Q15562	447 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	MEA1	Q16626	185 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	FIGN	Q5HY92	759 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	RAB41	Q5JT25	222 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	PIGZ	Q86VD9	579 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	NUP93	Q8N1F7	819 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	LEMD2	Q8NC56	503 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	UBA3	Q8TBC4	463 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	FGF13	Q92913	245 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	CD320	Q9NPF0	282 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	FAM50B	Q9Y247	325 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	LRRC53	A6NM62	1247 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	GYPC	P04921	128 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	CYP11B1	P15538	503 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	FCAR	P24071	287 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	GPD2	P43304	727 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	SPAG5	Q96R06	1193 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	HESX1	Q9UBX0	185 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	UST	Q9Y2C2	406 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	COL4A2	P08572	1712 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	C5orf42	Q9H799	3197 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405		A0A1W2PQJ5	194 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	ZNF197	O14709	1029 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	CBFA2T2	O43439	604 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	CHRNB2	P17787	502 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	CDC25C	P30307	473 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	STAT1	P42224	750 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	PDE6C	P51160	858 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	KIF11	P52732	1056 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	PTK2	Q05397	1052 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	PMF1	Q6P1K2	205 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	PASD1	Q8IV76	773 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	VSTM4	Q8IW00	320 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	FBXO32	Q969P5	355 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	SYT11	Q9BT88	431 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	GMIP	Q9P107	970 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	CDH7	Q9ULB5	785 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	USP3	Q9Y6I4	520 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	COL4A3	Q01955	1670 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	C2orf78	A6NCI8	922 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	MED7	O43513	233 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	PRAMEF12	O95522	483 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	FGF19	O95750	216 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	MME	P08473	750 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	LAMP2	P13473	410 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	YWHAQ	P27348	245 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	RGS7	P49802	495 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	FMO1	Q01740	532 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	ADIG	Q0VDE8	80 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	TAF10	Q12962	218 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	PDCL	Q13371	301 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	TAF12	Q16514	161 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	TAF3	Q5VWG9	929 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	NMUR1	Q9HB89	426 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	COMMD8	Q9NX08	183 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	OSER1	Q9NX31	292 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	MYO6	Q9UM54	1294 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PHF20-208	ENST00000461405	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PHF20-208	ENST00000461405	OLFM2	O95897	454 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PHF20-208	ENST00000461405	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PHF20-208	ENST00000461405	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.8 ms