RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342018.12

GTF3C5-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 5, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GTF3C5, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5-201ENST00000342018 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 TCF25Q9BQ70 676 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 PLVAPQ9BX97 442 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 WDR35Q9P2L0 1181 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 STK39Q9UEW8 545 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 GRID2IPA4D2P6 1211 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 KRT3P12035 628 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 ERVFC1P60507 584 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 CRISPLD1Q9H336 500 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 VNN2O95498 520 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 DNAJB1P25685 340 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 TAP1Q03518 808 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 FEZF2Q8TBJ5 459 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 SPPL3Q8TCT6 385 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 GPR152Q8TDT2 470 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 KCTD13Q8WZ19 329 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 MCRS1Q96EZ8 462 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 PTPRDP23468 1912 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa20.34■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 HHLA1C9JL84 531 aa20.34■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 FTCDO95954 541 aa20.34■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 CASQ1P31415 396 aa20.34■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 TAF5Q15542 800 aa20.34■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 OLFML1Q6UWY5 402 aa20.34■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 EMC1Q8N766 993 aa20.34■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 JOSD2Q8TAC2 188 aa20.34■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 MSRAQ9UJ68 235 aa20.34■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 ENC1O14682 589 aa20.33■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 TEX28O15482 410 aa20.33■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 USP17L7P0C7H9 530 aa20.33■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 RPL34P49207 117 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 SLC6A3Q01959 620 aa20.33■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 SMARCB1Q12824 385 aa20.33■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 VSTM1Q6UX27 236 aa20.33■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 SCAMP5Q8TAC9 235 aa20.33■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 ULBP1Q9BZM6 244 aa20.33■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 CYLDQ9NQC7 956 aa20.33■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa20.33■□□□□ 0.85
GTF3C5-201ENST00000342018 SIGLEC16A6NMB1 481 aa20.33■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 MYO1FO00160 1098 aa20.33■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 TRIM66O15016 1216 aa20.33■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 FANCGO15287 622 aa20.33■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 GRM6O15303 877 aa20.33■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 MTA2O94776 668 aa20.33■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 CNPP09543 421 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 TCEAL1Q15170 157 aa20.33■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.33■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 ZNF461Q8TAF7 563 aa20.33■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 ABCB6Q9NP58 842 aa20.33■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 TLR9Q9NR96 1032 aa20.33■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 LZTS1Q9Y250 596 aa20.33■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 C5orf67F2Z3F1 127 aa20.32■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 LILRB3O75022 631 aa20.32■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 RB1P06400 928 aa20.32■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 MAGEA11P43364 429 aa20.32■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 DNA2P51530 1060 aa20.32■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 SLC5A3P53794 718 aa20.32■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 GSCP56915 257 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa20.32■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 TDHQ8IZJ6 230 aa20.32■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.32■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 UBXN6Q9BZV1 441 aa20.32■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 CYP4F11Q9HBI6 524 aa20.32■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 CHD9Q3L8U1 2897 aa20.31■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 TMEM191CA6NGB0 347 aa20.31■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 NCK2O43639 380 aa20.31■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 SEC24AO95486 1093 aa20.31■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 SPATA31D3P0C874 917 aa20.31■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 HADHBP55084 474 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 ERVK-21P61565 698 aa20.31■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 CREMQ03060 361 aa20.31■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 GPM6BQ13491 265 aa20.31■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 RAB33AQ14088 237 aa20.31■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 RAB41Q5JT25 222 aa20.31■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa20.31■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.31■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa20.31■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 LRRC57Q8N9N7 239 aa20.31■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 GIPC2Q8TF65 315 aa20.31■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 FNIP2Q9P278 1114 aa20.31■□□□□ 0.84
GTF3C5-201ENST00000342018 LAMA3Q16787 3333 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms