RNA–Protein interactions for RNA: YML027W

YOX1, Transcript of Homeobox transcriptional repressor, yeast

Gene YOX1, Length 1,158 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOX1	YML027W	MHR1	Q06630	226 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	ATP14	Q12349	124 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	PEX22	P39718	180 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	YJR146W	P47174	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	YOP1	Q12402	180 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	YDR010C	Q12426	110 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	PFY1	P07274	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	DAD2	P36162	133 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	YEL008W	P40001	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
YOX1	YML027W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	YBR219C	P38317	127 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	ECM12	O13529	151 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	PET8	P38921	284 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	MGR2	Q02889	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	TOS6	P48560	102 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	APS1	P35181	156 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	YMR295C	Q03559	197 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	YDL241W	Q07738	123 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	YAL065C	O13511	128 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	HAC1	P41546	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	YKL070W	P36087	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	PAU15	P40585	124 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	PAU3	P25610	124 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	CWP2	P43497	92 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YOX1	YML027W	YLR415C	O13578	112 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YOX1	YML027W	AQY2	P0CD90	149 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YOX1	YML027W	VMA21	P41806	77 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YOX1	YML027W	EOS1	P53938	366 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YOX1	YML027W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YOX1	YML027W	YGL149W	P53116	101 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YOX1	YML027W	ERV14	P53173	138 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YOX1	YML027W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YOX1	YML027W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YOX1	YML027W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YOX1	YML027W	CNB1	P25296	175 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YOX1	YML027W	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YOX1	YML027W	STF1	P01098	86 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YOX1	YML027W	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YOX1	YML027W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.49	□□□□□ -1.69	not detected
YOX1	YML027W	OXA1	P39952	402 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YOX1	YML027W	YFL019C	P43576	117 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YOX1	YML027W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YOX1	YML027W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YOX1	YML027W	COX14	P39103	70 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YOX1	YML027W	YGL118C	P53132	145 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YOX1	YML027W	PPT2	Q12036	173 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YOX1	YML027W	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YOX1	YML027W	TOA2	P32774	122 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YOX1	YML027W	PAU16	P35994	123 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YOX1	YML027W	ABF2	Q02486	183 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YOX1	YML027W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YOX1	YML027W	YBL039W-B	P0C268	59 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YOX1	YML027W	CDC43	P18898	376 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YOX1	YML027W	ATP15	P21306	62 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YOX1	YML027W	YGL193C	P53097	103 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YOX1	YML027W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YOX1	YML027W	YLR156W	P0CE96	114 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YOX1	YML027W	YLR159W	P0CE97	114 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YOX1	YML027W	YLR161W	P0CE98	114 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YOX1	YML027W	MVB12	P42939	101 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YOX1	YML027W	SHU1	P38751	150 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YOX1	YML027W	KNH1	P50112	268 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YOX1	YML027W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YOX1	YML027W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
YOX1	YML027W	YOR268C	Q08734	132 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YOX1	YML027W	CMC4	Q3E7A9	73 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YOX1	YML027W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YOX1	YML027W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YOX1	YML027W	UBC4	P15731	148 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YOX1	YML027W	IGD1	P43598	195 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YOX1	YML027W	KTI11	Q3E840	82 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YOX1	YML027W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YOX1	YML027W	CYT2	Q00873	224 aa		4.39	□□□□□ -1.71

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