RNA–Protein interactions for RNA: YLR219W

MSC3, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene MSC3, Length 2,187 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSC3	YLR219W	DPP1	Q05521	289 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSC3	YLR219W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSC3	YLR219W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	UGX2	P32772	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	TEM1	P38987	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	YER076C	P40049	302 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	ATP23	P53722	227 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	HAL1	Q01766	294 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	MGR2	Q02889	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	PFY1	P07274	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	OXA1	P39952	402 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	DCV1	P43595	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	YJL028W	P47062	111 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	DGA1	Q08650	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	YPT53	P36019	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	UBC5	P15732	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	TOS6	P48560	102 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	PMP3	P87284	55 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	CRC1	Q12289	327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	SLO1	Q3E784	85 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC3	YLR219W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	YNL184C	P53876	108 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	YJR146W	P47174	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	PAU16	P35994	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	YGL088W	P53151	121 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	COA6	Q3E846	104 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	ERV14	P53173	138 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	ABF2	Q02486	183 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	YBR209W	P38311	105 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	GLC8	P41818	229 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	YPL257W	Q08974	193 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	MRP49	P32388	137 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
MSC3	YLR219W	RPR2	P40571	144 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	YIL059C	P40520	121 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	TRP1	P00912	224 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	SCM4	P32564	187 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	CNL1	Q06333	122 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	YEL008W	P40001	126 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC3	YLR219W	SPC1	P46965	94 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	SEC11	P15367	167 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	APS1	P35181	156 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	HAC1	P41546	238 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	YKR041W	P36134	250 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	UBC11	P52492	156 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	FUN14	P18411	198 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	PBA1	Q05778	276 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	ATP15	P21306	62 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	YBR219C	P38317	127 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	YGL230C	P53074	147 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	YMR320W	Q04897	101 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	MMS2	P53152	137 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	YDR115W	Q04598	105 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	MRPL44	P19956	98 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	BET5	Q03630	159 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	NAT5	Q08689	176 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	AIM11	P87275	137 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	YPL261C	Q08976	102 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	RRT15	Q3E811	62 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSC3	YLR219W	RTC6	O14464	93 aa		4.71	□□□□□ -1.65

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