RNA–Protein interactions for RNA: YJL054W

TIM54, Transcript of Component of the mitochondrial TIM22 complex, yeastyeast

Gene TIM54, Length 1,437 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIM54YJL054W LCL1Q02786 101 aa3.58□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W YDR029WQ12111 104 aa3.58□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W ENV10Q99382 181 aa3.58□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W ADH2P00331 348 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W TRP1P00912 224 aa3.57□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W PFY1P07274 126 aa3.57□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W AIM29P36154 155 aa3.57□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W PET8P38921 284 aa3.57□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W PAU15P40585 124 aa3.57□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W YJR146WP47174 117 aa3.57□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W OST3P48439 350 aa3.57□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W YLR194CQ05777 254 aa3.57□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W YBL081WP38180 368 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W VMA21P41806 77 aa3.56□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W YFL067WP43537 175 aa3.56□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W WIP1Q2V2P8 89 aa3.56□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W YLR307C-AQ3E825 87 aa3.56□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data3.55□□□□□ -1.84not detected
TIM54YJL054W YAL064WP39711 94 aa3.55□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W YER085CP40058 173 aa3.55□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W CIN5P40917 295 aa3.55□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W SNA2P56508 79 aa3.55□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W MGR2Q02889 113 aa3.55□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W YOR008C-AQ3E7B9 74 aa3.55□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W YCL021W-AQ96VH3 125 aa3.55□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W YAR029WP39549 74 aa3.54□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W YEL008WP40001 126 aa3.54□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W TOS6P48560 102 aa3.54□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W YMR230W-AQ3E7B5 62 aa3.54□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W SEC4P07560 215 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W SMP1P38128 452 aa3.53□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W PKR1Q03880 122 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W YMR175W-AQ3E766 64 aa3.53□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W YCR024C-BQ3E7Z8 88 aa3.53□□□□□ -1.84
TIM54YJL054W YBR219CP38317 127 aa3.53□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W YIL014C-AQ02598 104 aa3.53□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W YPR014CQ6B0W2 109 aa3.53□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W PRE1P22141 198 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W CNB1P25296 175 aa3.52□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W POR1P04840 283 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W PAU19P0CE85 124 aa3.51□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W PAU21P0CE86 164 aa3.51□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W PAU22P0CE87 164 aa3.51□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W PAU3P25610 124 aa3.51□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W PEX22P39718 180 aa3.5□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data3.5□□□□□ -1.85not detected
TIM54YJL054W MMS2P53152 137 aa3.5□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W ERV14P53173 138 aa3.5□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W YMR295CQ03559 197 aa3.5□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W YDL241WQ07738 123 aa3.5□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W PPT2Q12036 173 aa3.5□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W YAL065CO13511 128 aa3.49□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W APS1P35181 156 aa3.49□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W TPT1Q12272 230 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W YGL041C-BQ3E750 60 aa3.49□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W YGL118CP53132 145 aa3.48□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W YJL197C-AP0C5P0 93 aa3.47□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W HMRA2P0CY13 119 aa3.47□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W YCR007CP25354 239 aa3.47□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W AIM19P40502 157 aa3.47□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W HHO1P53551 258 aa3.47□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W ZEO1Q08245 113 aa3.47□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W HTL1Q9URQ5 78 aa3.47□□□□□ -1.85
TIM54YJL054W ECM12O13529 151 aa3.46□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W COA3Q3E7B2 85 aa3.46□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W YBL112CQ3E7Y4 105 aa3.46□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W DDR48P18899 430 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W RPF1P38805 295 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W NSE4P43124 402 aa3.45□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W CYT2Q00873 224 aa3.45□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W YDR042CQ03205 200 aa3.45□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W MHR1Q06630 226 aa3.45□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W CMC2Q3E7A4 109 aa3.45□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W AQY2P0CD90 149 aa3.44□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W GSP1P32835 219 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W YKL070WP36087 169 aa3.44□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W COX14P39103 70 aa3.44□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W STF1P01098 86 aa3.44□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W ATP15P21306 62 aa3.44□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W GSP2P32836 220 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W CWP2P43497 92 aa3.44□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W YDR010CQ12426 110 aa3.44□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W PAU16P35994 123 aa3.43□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W OXA1P39952 402 aa3.43□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W GTT1P40582 234 aa3.43□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W TOA2P32774 122 aa3.42□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W SHU1P38751 150 aa3.42□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W POP3P53833 195 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W HAC1P41546 238 aa3.41□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W YMR103CQ04436 120 aa3.41□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W Q0032Q9ZZX7 96 aa3.41□□□□□ -1.86
TIM54YJL054W CPR1P14832 162 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TIM54YJL054W ABF2Q02486 183 aa3.4□□□□□ -1.87
TIM54YJL054W HYP2P23301 157 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TIM54YJL054W YER134CP40081 178 aa3.39□□□□□ -1.87
TIM54YJL054W MVB12P42939 101 aa3.39□□□□□ -1.87
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