RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595033.5

FCHO1-208, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene FCHO1, Length 2,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-208ENST00000595033 GABBR1Q9UBS5 961 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 LPXNO60711 386 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 LYNP07948 512 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 NPTX2P47972 431 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 CYP24A1Q07973 514 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 RASA2Q15283 850 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 BBS9Q3SYG4 887 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 XKR9Q5GH70 373 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 SPDYAQ5MJ70 313 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 TRIM50Q86XT4 487 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 TREML1Q86YW5 311 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 MZB1Q8WU39 189 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 OPTNQ96CV9 577 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 MECRQ9BV79 373 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 FOXP3Q9BZS1 431 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 ATP2A1O14983 1001 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 PMM2O15305 246 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 GSTA2P09210 222 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 KITP10721 976 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 GJA5P36382 358 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 LMNB2Q03252 620 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 SLC5A9Q2M3M2 681 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 LIN9Q5TKA1 542 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 ZNF398Q8TD17 642 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 DCAKDQ8WVC6 231 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 BSNDQ8WZ55 320 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 PPP1R16BQ96T49 567 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 PSMC5P62195 406 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 CUL3Q13618 768 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 ADGRD1Q6QNK2 874 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 MCF2L2Q86YR7 1114 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 IGDCC3Q8IVU1 814 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 TIPINQ9BVW5 301 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 TEX13BQ9BXU2 312 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 VPS11Q9H270 941 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 ZNF862O60290 1169 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 FAM155BO75949 473 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 MT-ND3P03897 115 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 PYGBP11216 843 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 QARSP47897 775 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 VCPP55072 806 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 NOMO3P69849 1222 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 GCNT1Q02742 428 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 MCL1Q07820 350 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 GRM1Q13255 1194 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 OASLQ15646 514 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 SMTNL2Q2TAL5 461 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 PALM2Q8IXS6 379 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 CFAP61Q8NHU2 1237 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 CPT1BQ92523 772 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 MCEEQ96PE7 176 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 PANX3Q96QZ0 392 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 THTPAQ9BU02 230 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 EHMT1Q9H9B1 1298 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 PPM1HQ9ULR3 514 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 CHMP2BQ9UQN3 213 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 SBF1O95248 1867 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 ANPEPP15144 967 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 RTP1P59025 263 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 OGDHQ02218 1023 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 CNPY1Q3B7I2 92 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 CEP128Q6ZU80 1094 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 COPS5Q92905 334 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 TRIM11Q96F44 468 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 ZNF212Q9UDV6 495 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 SPATA31D3P0C874 917 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 MAPTP10636 758 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 TNNI1P19237 187 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 GNA15P30679 374 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 RANBP1P43487 201 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 NCKAP1LP55160 1127 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 FAAP100Q0VG06 881 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 LY6KQ17RY6 165 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 KCNT1Q5JUK3 1230 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 RCOR2Q8IZ40 523 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-208ENST00000595033 ATP11CQ8NB49 1132 aa12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms