RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409915.8

SF3B1-202, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SF3B1, Length 600 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1-202ENST00000409915 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa4.9□□□□□ -1.63
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SF3B1-202ENST00000409915 TELO2Q9Y4R8 837 aa4.9□□□□□ -1.63
SF3B1-202ENST00000409915 SNX13Q9Y5W8 968 aa4.9□□□□□ -1.63
SF3B1-202ENST00000409915 ELP1O95163 1332 aa4.9□□□□□ -1.63
SF3B1-202ENST00000409915 STK36Q9NRP7 1315 aa4.9□□□□□ -1.63
SF3B1-202ENST00000409915 ALPK3Q96L96 1907 aa4.89□□□□□ -1.63
SF3B1-202ENST00000409915 ESYT2A0FGR8 921 aa4.89□□□□□ -1.63
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SF3B1-202ENST00000409915 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa4.89□□□□□ -1.63
SF3B1-202ENST00000409915 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa4.89□□□□□ -1.63
SF3B1-202ENST00000409915 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa4.89□□□□□ -1.63
SF3B1-202ENST00000409915 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa4.88□□□□□ -1.63
SF3B1-202ENST00000409915 A0A1B0GTH6 734 aa4.88□□□□□ -1.63
SF3B1-202ENST00000409915 FAM86B1E9PN63 330 aa4.88□□□□□ -1.63
SF3B1-202ENST00000409915 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SF3B1-202ENST00000409915 PDLIM1O00151 329 aa4.88□□□□□ -1.63
SF3B1-202ENST00000409915 MASP2O00187 686 aa4.88□□□□□ -1.63
SF3B1-202ENST00000409915 FFAR2O15552 330 aa4.88□□□□□ -1.63
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