RNA–Protein interactions for RNA: YPR057W

BRR1, Transcript of snRNP protein component of spliceosomal snRNPs, yeastyeast

Gene BRR1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRR1YPR057W RTG1P32607 177 aa7.17□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W YKR032WP36127 104 aa7.17□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W YMR244WQ04018 355 aa7.17□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W PET8P38921 284 aa7.16□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W MIG3P39943 394 aa7.16□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W MRPL44P19956 98 aa7.15□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W KEG1P43614 200 aa7.15□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W MIC26P50087 233 aa7.15□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W ALG13P53178 202 aa7.15□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W MRPS8Q03799 155 aa7.15□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W CNL1Q06333 122 aa7.15□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W YGR035W-AQ45U48 73 aa7.15□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W YBR144CP34215 104 aa7.14□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W ECM33P38248 429 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W MPC2P38857 129 aa7.14□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W MOT3P54785 490 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W YIL014C-AQ02598 104 aa7.14□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W TPT1Q12272 230 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W YBR200W-AQ3E755 54 aa7.14□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W FYV7Q12247 151 aa7.13□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W MSN1P22148 382 aa7.12□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W ELF1P36053 145 aa7.12□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W POP3P53833 195 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W MGR2Q02889 113 aa7.12□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W DPP1Q05521 289 aa7.12□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W HTL1Q9URQ5 78 aa7.12□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W AGE2P40529 298 aa7.11□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W DUO1P53168 247 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W YDR366CP87287 132 aa7.11□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W TVP18Q04767 167 aa7.11□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W YPR014CQ6B0W2 109 aa7.11□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W Q0255P03881 472 aa7.1□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W KTI12P34253 313 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W YPR053CQ6Q5F3 151 aa7.1□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W SAL1D6W196 494 aa7.09□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W PFY1P07274 126 aa7.09□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W RPL16BP26785 198 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W YER076CP40049 302 aa7.09□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W ATP23P53722 227 aa7.09□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W YDR042CQ03205 200 aa7.09□□□□□ -1.27
BRR1YPR057W RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W YCR023CP25351 611 aa7.08□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W HAC1P41546 238 aa7.08□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W YFR035CP43608 114 aa7.08□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W GRH1Q04410 372 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W ATP5P09457 212 aa7.07□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W AQY1P0CD91 305 aa7.07□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W PRE1P22141 198 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W PKR1Q03880 122 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W NAT5Q08689 176 aa7.07□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W SEC11P15367 167 aa7.06□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W YGL230CP53074 147 aa7.06□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W YDR274CP87283 123 aa7.06□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W AIM34Q03673 198 aa7.06□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W YDL157CQ12082 118 aa7.06□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W PCL2P25693 308 aa7.05□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W FYV4P38783 130 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W TOS6P48560 102 aa7.05□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W MSC3Q05812 728 aa7.05□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W YCR007CP25354 239 aa7.04□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W RRT13P40042 185 aa7.04□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W YCH1P42937 148 aa7.04□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W GLO1P50107 326 aa7.04□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W SAE3P89114 91 aa7.04□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W SCS22Q6Q595 175 aa7.04□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W APS1P35181 156 aa7.03□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W YKR070WP36151 352 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W VHS2P40463 436 aa7.03□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W MSL1P40567 111 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W YLR042CQ07990 161 aa7.03□□□□□ -1.28
BRR1YPR057W MIG1P27705 504 aa7.02□□□□□ -1.29
BRR1YPR057W DCV1P43595 202 aa7.02□□□□□ -1.29
BRR1YPR057W VPS71Q03433 280 aa7.02□□□□□ -1.29
BRR1YPR057W YLR112WQ12130 139 aa7.02□□□□□ -1.29
BRR1YPR057W CYC7P00045 113 aa7.01□□□□□ -1.29
BRR1YPR057W BET5Q03630 159 aa7.01□□□□□ -1.29
BRR1YPR057W YMR103CQ04436 120 aa7.01□□□□□ -1.29
BRR1YPR057W HMRA2P0CY13 119 aa6.99□□□□□ -1.29
BRR1YPR057W PAU23Q07987 124 aa6.99□□□□□ -1.29
BRR1YPR057W PAU17Q12370 124 aa6.99□□□□□ -1.29
BRR1YPR057W COA3Q3E7B2 85 aa6.99□□□□□ -1.29
BRR1YPR057W YOR008C-AQ3E7B9 74 aa6.99□□□□□ -1.29
BRR1YPR057W COX12Q01519 83 aa6.98□□□□□ -1.29
BRR1YPR057W DGA1Q08650 418 aa6.98□□□□□ -1.29
BRR1YPR057W MLF3P32047 452 aa6.97□□□□□ -1.29
BRR1YPR057W YKL044WP36092 106 aa6.97□□□□□ -1.29
BRR1YPR057W NUP42P49686 430 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
BRR1YPR057W SAP30P38429 201 aa6.96□□□□□ -1.3
BRR1YPR057W URM1P40554 99 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
BRR1YPR057W GLC8P41818 229 aa6.96□□□□□ -1.3
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