RNA–Protein interactions for RNA: YPL119C

DBP1, Transcript of Putative ATP-dependent RNA helicase of the DEAD-box protein family, yeast

Gene DBP1, Length 1,854 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DBP1	YPL119C	RRG8	Q06109	277 aa		7.39	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	NUM1	Q00402	2748 aa		7.39	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	SPI1	P40092	148 aa		7.38	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	YPL162C	Q12042	273 aa		7.38	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	YHR022C	P38763	256 aa		7.38	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	AGA1	P32323	725 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	YGL230C	P53074	147 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	ATP23	P53722	227 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	SIM1	P40472	476 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	YER135C	P40082	130 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	TVP18	Q04767	167 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	PRM3	Q08931	133 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	YCR023C	P25351	611 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	KEG1	P43614	200 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	FIP1	P45976	327 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	SAL1	D6W196	494 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	CCW12	Q12127	133 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
DBP1	YPL119C	CCW14	O13547	238 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	YER076C	P40049	302 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	VPS71	Q03433	280 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	PAU23	Q07987	124 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	PAU17	Q12370	124 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	HAP3	P13434	144 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	YCR007C	P25354	239 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	APS1	P35181	156 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	YDR042C	Q03205	200 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	AQY1	P0CD91	305 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	YCL042W	P25572	119 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	POP7	P38291	140 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	MGR2	Q02889	113 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	TAR1	Q8TGM6	124 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	SOH1	P38633	127 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	Q0255	P03881	472 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	PCL2	P25693	308 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	UTR5	P32630	166 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	MIG3	P39943	394 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	YMR244W	Q04018	355 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	PFY1	P07274	126 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	ELF1	P36053	145 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	YDL186W	P48568	277 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	BET5	Q03630	159 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	YMR103C	Q04436	120 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	VAR1	P02381	398 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	GLO1	P50107	326 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	HMRA2	P0CY13	119 aa		7.28	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	UIP3	P39547	235 aa		7.28	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	MIC26	P50087	233 aa		7.28	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	MRPS8	Q03799	155 aa		7.28	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	DGA1	Q08650	418 aa		7.28	□□□□□ -1.24
DBP1	YPL119C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		7.27	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	CWC27	Q02770	301 aa		7.26	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	YFR035C	P43608	114 aa		7.26	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	ALG13	P53178	202 aa		7.26	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	YDR366C	P87287	132 aa		7.26	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	RUB1	Q03919	77 aa		7.26	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	YLR112W	Q12130	139 aa		7.26	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	TOS6	P48560	102 aa		7.25	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	CIN5	P40917	295 aa		7.24	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	PRY2	P36110	329 aa		7.24	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	DCV1	P43595	202 aa		7.24	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	AIM34	Q03673	198 aa		7.23	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	YLR042C	Q07990	161 aa		7.23	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		7.23	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	YKL044W	P36092	106 aa		7.22	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	VHS2	P40463	436 aa		7.21	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	MSA1	Q08471	629 aa		7.21	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		7.21	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	COA3	Q3E7B2	85 aa		7.21	□□□□□ -1.25
DBP1	YPL119C	RRT13	P40042	185 aa		7.21	□□□□□ -1.26
DBP1	YPL119C	YPL073C	P40323	161 aa		7.21	□□□□□ -1.26
DBP1	YPL119C	YPL261C	Q08976	102 aa		7.21	□□□□□ -1.26
DBP1	YPL119C	YKL070W	P36087	169 aa		7.2	□□□□□ -1.26
DBP1	YPL119C	RTG1	P32607	177 aa		7.19	□□□□□ -1.26
DBP1	YPL119C	MPC2	P38857	129 aa		7.19	□□□□□ -1.26
DBP1	YPL119C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
DBP1	YPL119C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26

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