RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	RRT1	P38192	103 aa		4.46	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	MST28	P39552	234 aa		4.46	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	YIL012W	P40551	113 aa		4.46	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	YFL051C	P43552	160 aa		4.46	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	IMP2	P46972	177 aa		4.46	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.46	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	MIX17	Q03667	156 aa		4.46	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	RUB1	Q03919	77 aa		4.46	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	GTO3	Q04806	366 aa		4.46	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	YCR023C	P25351	611 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	TIR2	P33890	251 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	PRY2	P36110	329 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	COX16	P47081	118 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	CAB4	P53332	305 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	MSC3	Q05812	728 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.45	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	IRC25	Q07951	179 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	PAI3	P01094	68 aa		4.44	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	APS1	P35181	156 aa		4.44	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	YMR141C	P40211	102 aa		4.44	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	SED1	Q01589	338 aa		4.44	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.44	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	NCA3	P46955	337 aa		4.43	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	GPI19	Q04082	140 aa		4.43	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.43	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		4.43	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	DAL80	P26343	269 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	GPI18	P38211	433 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	POP7	P38291	140 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	CTR2	P38865	189 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	PET8	P38921	284 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	GLE2	P40066	365 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	RPR2	P40571	144 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	CIN5	P40917	295 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.42	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	MST27	P53176	234 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	SUR7	P54003	302 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	MGR2	Q02889	113 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	IES6	P32617	166 aa		4.41	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	YKR032W	P36127	104 aa		4.41	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	YHL044W	P38727	235 aa		4.41	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	YNL198C	P40166	100 aa		4.41	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	YLR296W	Q05898	108 aa		4.41	□□□□□ -1.7
PSH1	YOL054W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	ECM14	P38836	430 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	YHR140W	P38842	239 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	UBC7	Q02159	165 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	ATG39	Q06159	398 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	YPL257W	Q08974	193 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	TIM22	Q12328	207 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	PFY1	P07274	126 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	YER121W	P40076	114 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	YPL073C	P40323	161 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	YFL067W	P43537	175 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	DGA1	Q08650	418 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	JID1	Q12350	301 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	YER076C	P40049	302 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	SPI1	P40092	148 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	TOS6	P48560	102 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	POR2	P40478	281 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	ELC1	Q03071	99 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	IRC23	Q08416	157 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	SLO1	Q3E784	85 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	PHO85	P17157	305 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	YKR041W	P36134	250 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	SIM1	P40472	476 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	YGR219W	P53307	113 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	SCW10	Q04951	389 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	YKL070W	P36087	169 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	SNF11	P38956	169 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	DIA1	P54005	336 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	PPT2	Q12036	173 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	FCY1	Q12178	158 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	COX14	P39103	70 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	YER181C	P40097	107 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PSH1	YOL054W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71

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