RNA–Protein interactions for RNA: YOL005C

RPB11, Transcript of RNA polymerase II subunit B12.5, yeastyeast

Gene RPB11, Length 363 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPB11YOL005C PRM3Q08931 133 aa1□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C YPR013CQ12145 317 aa1□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C YPR108W-AQ3E7B3 70 aa1□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C YLR365WQ7LIF2 110 aa1□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C TAR1Q8TGM6 124 aa1□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C POR1P04840 283 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C SEC11P15367 167 aa0.99□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C YCR001WP25347 104 aa0.99□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C HYM1P32464 399 aa0.99□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C ECM31P38122 312 aa0.99□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C IPI1P38803 334 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C YER076CP40049 302 aa0.99□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C NSA2P40078 261 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C YPL073CP40323 161 aa0.99□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C MMS2P53152 137 aa0.99□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C CGR1P53188 120 aa0.99□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C GIM3P53900 129 aa0.99□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C KEI1Q06346 221 aa0.99□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C YHR007C-AQ07074 71 aa0.99□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C YNG1Q08465 219 aa0.99□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C POC4Q12245 148 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa0.99□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C PET20Q99373 253 aa0.99□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C MBF1O14467 151 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C SPS2P08459 502 aa0.98□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C SHB17P36136 271 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C SRL3P36167 246 aa0.98□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C RRT1P38192 103 aa0.98□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C YJR015WP47090 510 aa0.98□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C YJR111CP47148 283 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C DIE2P50076 525 aa0.98□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C UBC7Q02159 165 aa0.98□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C EST3Q03096 181 aa0.98□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C GRX3Q03835 250 aa0.98□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C SYM1Q06563 197 aa0.98□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C HRD1Q08109 551 aa0.98□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C DGA1Q08650 418 aa0.98□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C YLR146W-AQ2V2P1 62 aa0.98□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C YGL258W-AQ3E740 77 aa0.98□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C COA2Q3E823 68 aa0.98□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C QCR2P07257 368 aa0.97□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C MRS1P07266 363 aa0.97□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C YHR213WP0CI67 198 aa0.97□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C SPO13P23624 291 aa0.97□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C MRP17P28778 131 aa0.97□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C YBL071CP38185 102 aa0.97□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C LSM2P38203 95 aaKnown RBP0.97□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C VMA22P38784 181 aa0.97□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C MPC2P38857 129 aa0.97□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C SNF11P38956 169 aa0.97□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C TDA4P47153 279 aa0.97□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C MPC3P53311 146 aa0.97□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C COX12Q01519 83 aa0.97□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP0.97□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C YMR007WQ03675 126 aa0.97□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP0.97□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C SHH3Q04487 196 aa0.97□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C YOL014WQ08110 124 aa0.97□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP0.97□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C YGL194C-AQ2V2P6 80 aa0.97□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C IGO2Q9P305 131 aa0.97□□□□□ -2.25
RPB11YOL005C QCR7P00128 127 aa0.96□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C SPT14P32363 452 aa0.96□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C UTP11P34247 250 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C FMP23P38231 175 aa0.96□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C YBR242WP38331 238 aa0.96□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C YEA6P39953 335 aa0.96□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C YEA4P40004 342 aa0.96□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C GAT4P40569 121 aa0.96□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C YFR035CP43608 114 aa0.96□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C GPI2P46961 280 aa0.96□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C ARO8P53090 500 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C JAC1P53193 184 aa0.96□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C TOM7P53507 60 aa0.96□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C YIP3P53633 176 aa0.96□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C FRQ1Q06389 190 aa0.96□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C YOR385WQ08909 290 aa0.96□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C YOR015WQ12169 119 aa0.96□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C SFT2P38166 215 aa0.95□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C DER1P38307 211 aa0.95□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C TRS20P38334 175 aa0.95□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C YMR141CP40211 102 aa0.95□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C YGR269WP40326 108 aa0.95□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C YIL163CP40448 117 aa0.95□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C POG1P40473 351 aa0.95□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C POR2P40478 281 aa0.95□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C MIC27P50945 234 aa0.95□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C YGR017WP53210 297 aa0.95□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C SGF11Q03067 99 aa0.95□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C YMR295CQ03559 197 aa0.95□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C SDH7Q04401 133 aa0.95□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C RRT15Q3E811 62 aa0.95□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C YML100W-AQ8TGT0 57 aa0.95□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C VAR1P02381 398 aa0.94□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C ANB1P19211 157 aa0.94□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C CNB1P25296 175 aa0.94□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C RPL14AP36105 138 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RPB11YOL005C YBR090CP38253 122 aa0.94□□□□□ -2.26
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