RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)G

tF(GAA)G, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)G, Length 73 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)GtF(GAA)G TOA2P32774 122 aa0.07□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G YBR027CP38220 110 aa0.07□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G YPC1P38298 316 aa0.07□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data0.07□□□□□ -2.4not detected
tF(GAA)GtF(GAA)G YER085CP40058 173 aa0.07□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G GPI14P47088 403 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G DDR2P89113 61 aa0.07□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G SNZ1Q03148 297 aa0.07□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G TLG1Q03322 224 aa0.07□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G FAR8Q05040 523 aa0.07□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G NMA1Q06178 401 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G PAM18Q07914 168 aa0.07□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G YML054C-AQ3E809 52 aa0.07□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G UBA3Q99344 299 aa0.07□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G ATP6P00854 259 aa0.06□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G STF1P01098 86 aa0.06□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G SFK1P35735 353 aa0.06□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G SHU1P38751 150 aa0.06□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G PET100P38958 111 aa0.06□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G GVP36P40531 326 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G PRM8P53174 237 aa0.06□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G PAU12P53343 120 aa0.06□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G PLP1Q04004 230 aa0.06□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G GPI11Q06636 219 aa0.06□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G YPL119C-AQ3E751 87 aa0.06□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G YBR255C-AQ3E776 120 aa0.06□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G YMR316C-AI2HB70 103 aa0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G HTB2P02294 131 aa0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G RPL24AP04449 155 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G QCR2P07257 368 aa0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G YBL039W-BP0C268 59 aa0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G ATP7P30902 174 aa0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G UTP11P34247 250 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G MRP8P35719 219 aa0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G PAU24P38155 120 aa0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G YBR209WP38311 105 aa0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G YHR122WP38829 231 aa0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G OXA1P39952 402 aa0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G SMX2P40204 77 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G POG1P40473 351 aa0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G YIA6P40556 373 aa0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G MSS2P40990 351 aa0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G SYS1P41544 203 aa0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G PAM16P42949 149 aa0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G SHH4Q06236 168 aa0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G FSF1Q12029 327 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G ISU2Q12056 156 aa0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G ATX2Q12067 313 aa0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G POC4Q12245 148 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G YMR230W-AQ3E7B5 62 aa0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G SCS22Q6Q595 175 aa0.05□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G YAL065CO13511 128 aa0.04□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G MRS1P07266 363 aa0.04□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G PAU2P32612 120 aa0.04□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G YBR219CP38317 127 aa0.04□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G YAR029WP39549 74 aa0.04□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G MIC27P50945 234 aa0.04□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G YGL088WP53151 121 aa0.04□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G THG1P53215 237 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G TIM21P53220 239 aa0.04□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G SUB1P54000 292 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G GTO3Q04806 366 aa0.04□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G YMR252CQ04814 134 aa0.04□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G DYN3Q04949 312 aa0.04□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G SPC2Q04969 178 aa0.04□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G LSP1Q12230 341 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G PAU19P0CE85 124 aa0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G PAU21P0CE86 164 aa0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G PAU22P0CE87 164 aa0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G GCN3P14741 305 aa0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G PAU3P25610 124 aa0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G HMX1P32339 317 aa0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G RPN12P32496 274 aa0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G SPT4P32914 102 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data0.03□□□□□ -2.4not detected
tF(GAA)GtF(GAA)G POP8P38208 133 aa0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G ERV15P38312 142 aa0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G PET8P38921 284 aa0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G YEA4P40004 342 aa0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G YMR141CP40211 102 aa0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G MAM33P40513 266 aa0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G PAU15P40585 124 aa0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G FAR7P43592 221 aa0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G TMA22P47089 198 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G YGL117WP53133 265 aa0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G HCH1P53834 153 aa0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G ABF2Q02486 183 aa0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G YML018CQ03730 393 aa0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G PEX27Q08580 376 aa0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G TPT1Q12272 230 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G YLR342W-AQ3E810 57 aa0.03□□□□□ -2.4
tF(GAA)GtF(GAA)G RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
tF(GAA)GtF(GAA)G RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
tF(GAA)GtF(GAA)G RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
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