RNA–Protein interactions for RNA: YKL033W

TTI1, Transcript of Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling, yeast

Gene TTI1, Length 3,117 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TTI1	YKL033W	SFT2	P38166	215 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	MBA1	P38300	278 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YBR209W	P38311	105 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YHR022C	P38763	256 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	COX14	P39103	70 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	SPC1	P46965	94 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	AIM25	P47140	327 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	SNA2	P56508	79 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	DPP1	Q05521	289 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	LOA1	Q06508	300 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	SCP1	Q08873	200 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	GPX2	P38143	162 aa		0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YIL163C	P40448	117 aa		0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YIL059C	P40520	121 aa		0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	IGD1	P43598	195 aa		0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	HST4	P53688	370 aa		0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	GPI15	P53961	229 aa		0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	TMA23	Q03525	211 aa		0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	SHH3	Q04487	196 aa		0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	DXO1	Q06349	442 aa		0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	SCM3	Q12334	223 aa		0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	MED11	Q99278	115 aa		0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	ISN1	Q99312	450 aa		0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	DDI2	P0CH63	225 aa		0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	DDI3	P0CH64	225 aa		0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	HMX1	P32339	317 aa		0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YKL162C	P36052	402 aa		0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	ERV15	P38312	142 aa		0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	TEM1	P38987	245 aa		0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	HAC1	P41546	238 aa		0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	SER2	P42941	309 aa		0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YDR115W	Q04598	105 aa		0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		0.74	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YAL064W	P39711	94 aa		0.73	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	MGA1	P53050	456 aa		0.73	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	RAV2	Q03956	351 aa		0.73	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	DGA1	Q08650	418 aa		0.73	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		0.73	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	0.73	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	MIC27	P50945	234 aa		0.73	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	TIM21	P53220	239 aa		0.73	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	PDR17	P53844	350 aa		0.73	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	COA4	Q05809	96 aa		0.73	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	ATG31	Q12421	196 aa		0.73	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	0.73	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	RTC6	O14464	93 aa		0.73	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	QCR2	P07257	368 aa		0.73	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YBR013C	P38215	129 aa		0.73	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	KEG1	P43614	200 aa		0.73	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YMR253C	Q04835	414 aa		0.73	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YOR015W	Q12169	119 aa		0.73	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		0.73	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	KTI11	Q3E840	82 aa		0.73	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	DAD4	P69851	72 aa		0.72	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	SDH7	Q04401	133 aa		0.72	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YMR320W	Q04897	101 aa		0.72	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YDR029W	Q12111	104 aa		0.72	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	FZF1	P32805	299 aa		0.72	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	MRPL28	P36527	147 aa		0.72	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	PEX22	P39718	180 aa		0.72	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YGR269W	P40326	108 aa		0.72	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	0.72	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	COX16	P47081	118 aa		0.72	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	TPN1	P53099	579 aa		0.72	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	DID2	P69771	204 aa		0.72	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	AVO2	Q04749	426 aa		0.72	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		0.72	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		0.72	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	UBC5	P15732	148 aa		0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	CPT1	P17898	393 aa		0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	MRP17	P28778	131 aa		0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	ERG28	P40030	148 aa		0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YER076C	P40049	302 aa		0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	SWM2	P40342	146 aa		0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YDR366C	P87287	132 aa		0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YCT1	Q12235	531 aa		0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	TIR1	P10863	254 aa		0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	PET100	P38958	111 aa		0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	LCL1	Q02786	101 aa		0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		0.71	□□□□□ -2.3

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 48.7 ms