RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 HARSP12081 509 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 BRD2P25440 801 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 OGDHQ02218 1023 aa27.23■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 ERICH1Q86X53 443 aa27.23■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 GIMAP7Q8NHV1 300 aa27.23■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 CISHQ9NSE2 258 aa27.23■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 STRIP2Q9ULQ0 834 aa27.23■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 FAM189A1O60320 539 aa27.22■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 KCNJ2P63252 427 aa27.22■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 FAM160B1Q5W0V3 765 aa27.22■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 ASRGL1Q7L266 308 aa27.22■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 SLC35B2Q8TB61 432 aa27.22■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 RMDN2Q96LZ7 410 aa27.22■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 SMC6Q96SB8 1091 aa27.22■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 VPS37BQ9H9H4 285 aa27.22■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 FETUBQ9UGM5 382 aa27.22■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 LRRD1A4D1F6 860 aa27.22■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 CCNB1P14635 433 aa27.22■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 DUOXA2Q1HG44 320 aa27.22■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 SEZ6Q53EL9 994 aa27.22■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa27.22■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa27.21■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 MAFO75444 373 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 ETS1P14921 441 aa27.21■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 MYL6P60660 151 aa27.21■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 ADCY1Q08828 1119 aa27.21■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 TTC13Q8NBP0 860 aa27.21■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 FBF1Q8TES7 1133 aa27.21■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 MTMR12Q9C0I1 747 aa27.21■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 MROH8Q9H579 483 aa27.21■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 MORF4L1Q9UBU8 362 aa27.21■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 OGTO15294 1046 aa27.2■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 KRT15P19012 456 aa27.2■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 SREBF2Q12772 1141 aa27.2■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 WDR72Q3MJ13 1102 aa27.2■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 ECHDC2Q86YB7 292 aa27.2■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 IFNL1Q8IU54 200 aa27.2■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 ZBED8Q8IZ13 594 aa27.2■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 SHCBP1Q8NEM2 672 aa27.2■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 PCYT2Q99447 389 aa27.2■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 SGK1O00141 431 aa27.2■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 MSCO60682 206 aa27.2■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 TNFSF9P41273 254 aa27.2■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 CCNA1P78396 465 aa27.2■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 MGAT5Q09328 741 aa27.2■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 TRPC3Q13507 836 aa27.2■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 E2F5Q15329 346 aa27.2■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 PDK4Q16654 411 aa27.2■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 WDTC1Q8N5D0 677 aa27.2■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 SPAG7O75391 227 aa27.19■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 ATP5HO75947 161 aa27.19■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 EFHC2Q5JST6 749 aa27.19■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa27.19■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 CREBZFQ9NS37 354 aa27.19■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 TXLNGQ9NUQ3 528 aa27.19■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 KRT7P08729 469 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 PHBP35232 272 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 APLP1P51693 650 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 PLCB3Q01970 1234 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 IER5Q5VY09 327 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 TCHPQ9BT92 498 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 TMEM121Q9BTD3 319 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 USH1CQ9Y6N9 552 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 STAT5BP51692 787 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 YARSP54577 528 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 SETDB1Q15047 1291 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 HIF1AQ16665 826 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 WDR78Q5VTH9 848 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 SCARA3Q6AZY7 606 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 FAM47EQ6ZV65 393 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 ZBTB33Q86T24 672 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 PPIL6Q8IXY8 311 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 FNIP1Q8TF40 1166 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 FAM167AQ96KS9 214 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 ZIC5Q96T25 663 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 EBF2Q9HAK2 575 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 PHTF1Q9UMS5 762 aa27.18■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 SMAPO00193 183 aa27.17■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 GAS2O43903 313 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms