RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
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PTPRC-205ENST00000391970 ZSCAN32Q9NX65 697 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 SLC39A10Q9ULF5 831 aa3.74□□□□□ -1.81
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PTPRC-205ENST00000391970 BEAN1Q3B7T3 259 aa3.73□□□□□ -1.81
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PTPRC-205ENST00000391970 PLAG1Q6DJT9 500 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC174Q6PII3 467 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa3.73□□□□□ -1.81
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PTPRC-205ENST00000391970 TMEM108Q6UXF1 575 aa3.73□□□□□ -1.81
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PTPRC-205ENST00000391970 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 ANKRD42Q8N9B4 389 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF527Q8NB42 609 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 GLIS1Q8NBF1 620 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 IL17DQ8TAD2 202 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 BPIFB1Q8TDL5 484 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 MUL1Q969V5 352 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM125Q96AQ2 219 aa3.73□□□□□ -1.81
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PTPRC-205ENST00000391970 BOD1Q96IK1 185 aa3.73□□□□□ -1.81
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PTPRC-205ENST00000391970 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 CXorf36Q9H7Y0 433 aa3.73□□□□□ -1.81
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PTPRC-205ENST00000391970 NECTIN3Q9NQS3 549 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM74BQ9NUR3 256 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 SMPD4Q9NXE4 827 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 RGL1Q9NZL6 768 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 CEP72Q9P209 647 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 DKK4Q9UBT3 224 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 TESMINQ9Y4I5 508 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 CDY1Q9Y6F8 540 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 MYADML2A6NDP7 307 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 AQP7P3A6NL99 342 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 hCG_1984214I3L0E3 225 aa3.72□□□□□ -1.81
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PTPRC-205ENST00000391970 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
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PTPRC-205ENST00000391970 CRTC1Q6UUV9 634 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 KIAA0408Q6ZU52 694 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 MICALCLQ6ZW33 695 aa3.72□□□□□ -1.81
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