RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364072.1

RNU6-501P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 501, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-501P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-501P-201ENST00000364072 LRIT1Q9P2V4 623 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 SHOC2Q9UQ13 582 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 ADM5C9JUS6 153 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 PPM1DO15297 605 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 CHRM2P08172 466 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 LRPAP1P30533 357 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 CXCR5P32302 372 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 GNALP38405 381 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 MAPK10P53779 464 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 SLC44A4Q53GD3 710 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 PRR16Q569H4 304 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZNF280BQ86YH2 543 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 MPP5Q8N3R9 675 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 OR56A3Q8NH54 315 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 TFAP2BQ92481 460 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 SARGQ9BW04 601 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 BTBD1Q9H0C5 482 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 KIAA1586Q9HCI6 787 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 KLC4Q9NSK0 619 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 COL20A1Q9P218 1284 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 OGDHLQ9ULD0 1010 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-501P-201ENST00000364072 hCG_1984214I3L0E3 225 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 MGST3O14880 152 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 TRIM27P14373 513 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 RARRES1P49788 294 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 RPS16P62249 146 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 SP2Q02086 613 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 MYO1EQ12965 1108 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 C3orf38Q5JPI3 329 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 ARHGAP40Q5TG30 622 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 ICE2Q659A1 982 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 KAZNQ674X7 775 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZDHHC24Q6UX98 284 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 KRT78Q8N1N4 520 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 FKBP10Q96AY3 582 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 PBKQ96KB5 322 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 MSLNLQ96KJ4 702 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 ALG8Q9BVK2 526 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 APOL5Q9BWW9 433 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZNF287Q9HBT7 754 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 SERTAD3Q9UJW9 196 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 CSF1RP07333 972 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 PDHA1P08559 390 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 ELFN1P0C7U0 828 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 KLRC1P26715 233 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 PCSK6P29122 969 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 GRIA3P42263 894 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 CLK3P49761 638 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 DGKEP52429 567 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 E2F2Q14209 437 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 MGAT5BQ3V5L5 792 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 PLA1AQ53H76 456 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 DTX2Q86UW9 622 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 SIMC1Q8NDZ2 872 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 PHKBQ93100 1093 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 RFKQ969G6 155 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 SPSB4Q96A44 273 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 NUP62CLQ9H1M0 184 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 CXorf36Q9H7Y0 433 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 EHD3Q9NZN3 535 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 DKK3Q9UBP4 350 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 CCDC151A5D8V7 595 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 KIAA0355O15063 1070 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 SLC5A1P13866 664 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 IL1R1P14778 569 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 RPL17P18621 184 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 KCNA3P22001 575 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 SATB1Q01826 763 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 KRT17Q04695 432 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 TBCCQ15814 346 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 COBLL1Q53SF7 1204 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 MAVSQ7Z434 540 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 ATG4AQ8WYN0 398 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 CCDC136Q96JN2 1154 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 PRDM13Q9H4Q3 707 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-501P-201ENST00000364072 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms