RNA–Protein interactions for RNA: YKL216W

URA1, Transcript of Dihydroorotate dehydrogenase, yeast

Gene URA1, Length 945 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
URA1	YKL216W	PPQ1	P32945	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	PET100	P38958	111 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	PKP2	P53170	491 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	TMA23	Q03525	211 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		4.93	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	MBB1	P39534	108 aa		4.93	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	YDL183C	P48569	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	TIM44	Q01852	431 aa		4.93	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	PHO92	Q06390	306 aa		4.93	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	IES3	Q12345	250 aa		4.93	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	SPT14	P32363	452 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	YGR269W	P40326	108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	PBA1	Q05778	276 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	RTC6	O14464	93 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	VAR1	P02381	398 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	PUT1	P09368	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	YCH1	P42937	148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	YJL028W	P47062	111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	ARR3	Q06598	404 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	ISN1	Q99312	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	SPS2	P08459	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		4.9	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	YLR302C	O13544	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	Q0255	P03881	472 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	CPT1	P17898	393 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	COQ3	P27680	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	YEA6	P39953	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	YFL067W	P43537	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	ATP23	P53722	227 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	MRX11	Q03079	207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	CTR3	Q06686	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	RRT7	Q07829	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	ATX2	Q12067	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	PRR2	Q12310	699 aa		4.88	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.88	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	DER1	P38307	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	SPI1	P40092	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	DSK2	P48510	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	YDR366C	P87287	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	RPN13	O13563	156 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	RRT13	P40042	185 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	KEG1	P43614	200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	YDR034C-A	P0C289	58 aa		4.85	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	YBL059W	P34224	193 aa		4.85	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	ORM2	Q06144	216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	GCN3	P14741	305 aa		4.84	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	QCR9	P22289	66 aa		4.84	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	ACP1	P32463	125 aa		4.84	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	KRE9	P39005	276 aa		4.84	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	ATC1	Q04005	294 aa		4.84	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	FIT2	Q08906	153 aa		4.84	□□□□□ -1.63
URA1	YKL216W	HTB2	P02294	131 aa		4.83	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	MRS1	P07266	363 aa		4.83	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	YBR242W	P38331	238 aa		4.83	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	YMR007W	Q03675	126 aa		4.83	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	MRPL28	P36527	147 aa		4.82	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	YNL217W	P40152	326 aa		4.82	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	EMC5	P40540	141 aa		4.82	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	BRP1	P53194	125 aa		4.82	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	DID2	P69771	204 aa		4.82	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	DPP1	Q05521	289 aa		4.82	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	YLR042C	Q07990	161 aa		4.82	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	AGA1	P32323	725 aa		4.81	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	YEA4	P40004	342 aa		4.81	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	SVP26	P38869	228 aa		4.8	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	YKE4	P40544	346 aa		4.8	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	YGR017W	P53210	297 aa		4.8	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	AIM34	Q03673	198 aa		4.8	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	AVO2	Q04749	426 aa		4.8	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	YBR013C	P38215	129 aa		4.79	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	MGA1	P53050	456 aa		4.79	□□□□□ -1.64
URA1	YKL216W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64

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