RNA–Protein interactions for RNA: YJR059W

PTK2, Transcript of Putative serine/threonine protein kinase, yeast

Gene PTK2, Length 2,457 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PTK2	YJR059W	YOL118C	Q08259	102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YLR302C	O13544	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	GAL7	P08431	366 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	AQR1	P53943	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	MIX17	Q03667	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YDL180W	Q12301	547 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	VAR1	P02381	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	HEM4	P06174	275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	CPT1	P17898	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	NCE103	P53615	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	IRC19	Q07843	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	DGA1	Q08650	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YNR048W	P53740	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	ATP19	P81451	68 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YFH1	Q07540	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	JID1	Q12350	301 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YKL044W	P36092	106 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	MOH1	P38191	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	LIP2	Q06005	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	MST28	P39552	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	BNA2	P47125	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YHM2	Q04013	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	ECM18	Q04623	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	SUT2	Q12286	268 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	ERG8	P24521	451 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	MCH2	P36032	473 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	GEP3	Q08622	556 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	TIM18	Q08749	192 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	PCL2	P25693	308 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YHR173C	P38864	112 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YPI1	P43587	155 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	SDH7	Q04401	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	CYC3	P06182	269 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	SFT2	P38166	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YCH1	P42937	148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	APS1	P35181	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YJL193W	P39542	402 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	NUP53	Q03790	475 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	GTO3	Q04806	366 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	IRC25	Q07951	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	GRE1	Q08969	168 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YPS3	Q12303	508 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	FZF1	P32805	299 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YKR041W	P36134	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YJL118W	P47022	219 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	MRX11	Q03079	207 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	RAV2	Q03956	351 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	ATG33	Q06485	197 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2	YJR059W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	KRE1	P17260	313 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	MDM10	P18409	493 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	MRS3	P10566	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	YPL073C	P40323	161 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	HUA1	P40325	198 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	YIP3	P53633	176 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	YLR460C	P54007	376 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	API2	Q04413	109 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	HPA2	Q06592	156 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	YPS1	P32329	569 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	YER181C	P40097	107 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	YIL089W	P40500	205 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	PRY1	P47032	299 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	ATG21	Q02887	496 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	MSA1	Q08471	629 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	PAU7	P39545	55 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTK2	YJR059W	EGT2	P42835	1041 aa		4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.4 ms