RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481551.5

RBM48-202, Transcript of RNA binding motif protein 48, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RBM48, Length 4,093 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48-202ENST00000481551 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 ACP6Q9NPH0 428 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 PYCARDQ9ULZ3 195 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 DOCK4Q8N1I0 1966 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 A0A087X0T9 212 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 CYP26A1O43174 497 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 CYP1A2P05177 515 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 FAM228BP0C875 321 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 LAG3P18627 525 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 SCNN1AP37088 669 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 PLA2G4AP47712 749 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 LHX1P48742 406 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 NDST1P52848 882 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 RTP2Q5QGT7 225 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 TTC30AQ86WT1 665 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 FUKQ8N0W3 1084 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 ABCB6Q9NP58 842 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 TMLHEQ9NVH6 421 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 NAGPAQ9UK23 515 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 CDH9Q9ULB4 789 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 MYH10P35580 1976 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 CASTOR2A6NHX0 329 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 LPXNO60711 386 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 NDUFA10O95299 355 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 UBE3AQ05086 875 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 WDR44Q5JSH3 913 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 LILRA6Q6PI73 481 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 ADGRF2Q8IZF7 708 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 APOL6Q9BWW8 343 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 USP3Q9Y6I4 520 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 A0A0U1RQJ8 604 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 CYB561D2O14569 222 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 WEE2P0C1S8 567 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 VDRP11473 427 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 MAGEA11P43364 429 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 WSCD1Q658N2 575 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 SLFN11Q7Z7L1 901 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 TMEM110Q86TL2 294 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 ZNF276Q8N554 614 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 APPL2Q8NEU8 664 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 ATRIPQ8WXE1 791 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 MMEP08473 750 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 ODC1P11926 461 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 P4HA1P13674 534 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 MMP8P22894 467 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 BRCC3P46736 316 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 CACNA2D1P54289 1103 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 BIRC3Q13489 604 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 FUT10Q6P4F1 479 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 NT5C3BQ969T7 300 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 TAS2R14Q9NYV8 317 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 ABL1P00519 1130 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 SYN1P17600 705 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 KIF11P52732 1056 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 BPIFB4P59827 614 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 TAP1Q03518 808 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 TRPC3Q13507 836 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 STILQ15468 1287 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 PTPN14Q15678 1187 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 ASIC2Q16515 512 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 SNX30Q5VWJ9 437 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 TRIM72Q6ZMU5 477 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 TNS4Q8IZW8 715 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 LRRC57Q8N9N7 239 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 SPC24Q8NBT2 197 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM48-202ENST00000481551 SAMD11Q96NU1 681 aa6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms