RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IFT20Q8IY31 132 aa23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC43A3Q8NBI5 491 aa23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZFP42Q96MM3 310 aa23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MCEEQ96PE7 176 aa23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSPAN16Q9UKR8 245 aa23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NME7Q9Y5B8 376 aa23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SIGLEC16A6NMB1 481 aa23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM163BP0C2L3 166 aa23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CD52P31358 61 aa23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRK4P32298 578 aa23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AADACL2Q6P093 401 aa23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCUN1D2Q6PH85 259 aa23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT222Q8N1A0 295 aa23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NR2E1Q9Y466 385 aa23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP2K7O14733 419 aa23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GJB6O95452 261 aa23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GHRP10912 638 aa23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LILRA4P59901 499 aa23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PKDCCQ504Y2 493 aa23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGAP17Q68EM7 881 aa23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DPH6Q7L8W6 267 aa23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HDXQ7Z353 690 aa23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XYLT1Q86Y38 959 aa23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CRYBG2Q8N1P7 616 aa23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FNIP1Q8TF40 1166 aa23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OSBPL7Q9BZF2 842 aa23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MIS12Q9H081 205 aa23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MEIS3P2A8K0S8 358 aa23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SASH3O75995 380 aa23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERBB2P04626 1255 aa23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SETSIPP0DME0 302 aa23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYBL2P10244 700 aa23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MLH1P40692 756 aa23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAATS1Q7Z4T9 603 aa23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACOT1Q86TX2 421 aa23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TOP6BLQ8N6T0 577 aa23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C12orf29Q8N999 325 aa23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APPL2Q8NEU8 664 aa23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR6B3Q8NGW1 331 aa23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC26Q8TAB7 109 aa23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MCRS1Q96EZ8 462 aa23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNAI2Q9GZS0 605 aa23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A1W2PQY0 241 aa23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PFKMP08237 780 aa23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC38Q5VT99 294 aa23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AGMOQ6ZNB7 445 aa23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KATNAL2Q8IYT4 538 aa23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GAD1Q99259 594 aa23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYNCQ9H7C4 482 aa23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TJP2Q9UDY2 1190 aa23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A0U1RQF3 1178 aa23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MGEA5O60502 916 aa23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 THP07101 528 aa23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT3P12035 628 aa23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAS2R40P59535 323 aa23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GUCY2DQ02846 1103 aa23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP1B1Q16678 543 aa23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARL5CA6NH57 179 aa23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A8MXQ7 604 aa23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FSCN2O14926 492 aa23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HUS1O60921 280 aa23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHF2O75151 1096 aa23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CAPN15O75808 1086 aa23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FGFR1P11362 822 aa23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SKIP12755 728 aa23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WARSP23381 471 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OGDHQ02218 1023 aa23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF618Q5T7W0 954 aa23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRELID2Q8N945 189 aa23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBA3Q8TBC4 463 aa23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EPB41L5Q9HCM4 733 aa23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHRNA3P32297 505 aa23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADGRF2Q8IZF7 708 aa23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EXD1Q8NHP7 514 aa23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STK32AQ8WU08 396 aa23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms