RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471023.1

NOP56-211, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 592 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-211ENST00000471023 OGTO15294 1046 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 ITGA4P13612 1032 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 KCNE1P15382 129 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 DNAJB1P25685 340 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 ABCD1P33897 745 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 MLH1P40692 756 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 LIG4P49917 911 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 MRE11P49959 708 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 NHLH1Q02575 133 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 ITIH3Q06033 890 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 STRN3Q13033 797 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 NOMO2Q5JPE7 1267 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 C1orf220Q5T0J3 134 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 CES5AQ6NT32 575 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 TREML4Q6UXN2 200 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 NELFCDQ8IXH7 590 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 COLGALT2Q8IYK4 626 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 FAM84AQ96KN4 292 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 NECTIN4Q96NY8 510 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 GBP3Q9H0R5 595 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 TMEM206Q9H813 350 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 RSAD1Q9HA92 442 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 EXOC1Q9NV70 894 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 MARCH5Q9NX47 278 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 SPG21Q9NZD8 308 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 KLK14Q9P0G3 267 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 CNTN3Q9P232 1028 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 DNAJB4Q9UDY4 337 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 MUTYHQ9UIF7 546 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 NR2E1Q9Y466 385 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 TRIOO75962 3097 aa8.09□□□□□ -1.11
NOP56-211ENST00000471023 PTPRJQ12913 1337 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 A0A1W2PNR3 127 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 TMEM221A6NGB7 291 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 LACTBL1A8MY62 500 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 M0R296 226 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 CLIC2O15247 247 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 LINC01565O15544 149 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 CLDN3O15551 220 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 GALTP07902 379 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 CLTAP09496 248 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 VSIG8P0DPA2 414 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 CXCL8P10145 99 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.08□□□□□ -1.128e-9■□□□□ 9.7
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NOP56-211ENST00000471023 ACOT2P49753 483 aa8.08□□□□□ -1.12
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NOP56-211ENST00000471023 OSTNP61366 133 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 ZXDAP98168 799 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 SIGLEC14Q08ET2 396 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 DUSP6Q16828 381 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 ANKRD40Q6AI12 368 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 ISM2Q6H9L7 571 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 TTI2Q6NXR4 508 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 FOXR2Q6PJQ5 311 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 KCNT2Q6UVM3 1135 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 TMC7Q7Z402 723 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 CBWD2Q8IUF1 395 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 BRSK2Q8IWQ3 736 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 EFCAB13Q8IY85 973 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 LRRC43Q8N309 656 aa8.08□□□□□ -1.12
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NOP56-211ENST00000471023 SUSD6Q92537 303 aa8.08□□□□□ -1.12
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NOP56-211ENST00000471023 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 PGBD4Q96DM1 585 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 SAAL1Q96ER3 474 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 ZNF558Q96NG5 402 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 PAAF1Q9BRP4 392 aa8.08□□□□□ -1.12
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NOP56-211ENST00000471023 MSTO1Q9BUK6 570 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 APOL6Q9BWW8 343 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 PCIF1Q9H4Z3 704 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 HSPBP1Q9NZL4 362 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 CACNG4Q9UBN1 327 aa8.08□□□□□ -1.12
NOP56-211ENST00000471023 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
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