RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC39A12Q504Y0 691 aa28.29■■■□□ 2.12
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSMG2Q969U7 264 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 E2F7Q96AV8 911 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM213AQ9BRX8 229 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BACH2Q9BYV9 841 aa28.29■■■□□ 2.12
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITIH5Q86UX2 942 aa28.28■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYCP3Q8IZU3 236 aa28.28■■■□□ 2.12
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF263O14978 683 aa28.27■■■□□ 2.12
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAAL1Q96ER3 474 aa28.27■■■□□ 2.12
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KPNA7A9QM74 516 aa28.26■■■□□ 2.11
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STK38Q15208 465 aa28.26■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WSCD1Q658N2 575 aa28.26■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BRSK2Q8IWQ3 736 aa28.26■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YAF2Q8IY57 180 aa28.26■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDILTQ8N807 584 aa28.26■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BORCS6Q96GS4 357 aa28.26■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF560Q96MR9 790 aa28.26■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATXN3LQ9H3M9 355 aa28.26■■■□□ 2.11
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VEPH1Q14D04 833 aa28.25■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MGAT5BQ3V5L5 792 aa28.25■■■□□ 2.11
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIAS3Q9Y6X2 628 aa28.25■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL4A2P08572 1712 aa28.25■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa28.25■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDR1P51861 262 aa28.24■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WNT7BP56706 349 aa28.24■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa28.24■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC65Q8IXS2 484 aa28.24■■■□□ 2.11
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RSPRY1Q96DX4 576 aa28.24■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LPIN3Q9BQK8 851 aa28.24■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa28.24■■■□□ 2.11
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR158Q5T848 1215 aa28.23■■■□□ 2.11
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF687Q8N1G0 1237 aa28.23■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00301Q8NCQ3 95 aa28.23■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPPL2BQ8TCT7 592 aa28.23■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM3CQ92520 227 aa28.23■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MKNK1Q9BUB5 465 aa28.23■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM206Q9H813 350 aa28.23■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AGAP1Q9UPQ3 857 aa28.23■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FRYLO94915 3013 aa28.22■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 F5P12259 2224 aa28.22■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA8IPA6NC78 632 aa28.22■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA8JA6NMD2 632 aa28.22■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EXTL3O43909 919 aa28.22■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITGB3P05106 788 aa28.22■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATF6P18850 670 aa28.22■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FCHO2Q0JRZ9 810 aa28.22■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAF12Q16514 161 aa28.22■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPIHBP1Q8IV16 184 aa28.22■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa28.22■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CBWD1Q9BRT8 395 aa28.22■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
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