RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410856.1

RNU2-38P-201, Transcript of RNA, U2 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU2-38P, Length 79 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU2-38P-201ENST00000410856 VCPIP1Q96JH7 1222 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 C5orf34Q96MH7 638 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 OSBPL9Q96SU4 736 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 PROCRQ9UNN8 238 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 QSOX1O00391 747 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF213O14771 459 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 AMY1AP04745 511 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 ALPLP05186 524 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 CTXN1P60606 82 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 ATP8B2P98198 1209 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 GTF2H3Q13889 308 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 SEPT2Q15019 361 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF628Q5EBL2 1059 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF618Q5T7W0 954 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 TAPT1Q6NXT6 567 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 AOPEPQ8N6M6 819 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 C8orf58Q8NAV2 365 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 NINJ1Q92982 152 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 KLHL32Q96NJ5 620 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 ASB2Q96Q27 587 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 CAMKK2Q96RR4 588 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 CTAGE1Q96RT6 745 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 SMOQ99835 787 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM118BQ9BPY3 351 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 PACSIN1Q9BY11 444 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 ACTRT3Q9BYD9 372 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 OSBPL2Q9H1P3 480 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 PDGFCQ9NRA1 345 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 WDR17Q8IZU2 1322 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 F5H697 171 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC6A4P31645 630 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 ALDH9A1P49189 494 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 NDUFV1P49821 464 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 HTR6P50406 440 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC5A3P53794 718 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 TBCCQ15814 346 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 C18orf65Q6ZTR6 163 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 NIM1KQ8IY84 436 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 C16orf52Q8NHV5 167 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 CUL5Q93034 780 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRIB1Q96RU8 372 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 JKAMPQ9P055 326 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 NOTCH4Q99466 2003 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 CD8B2A6NJW9 211 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 H0YIZ8 118 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 GRM6O15303 877 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 SOAT2O75908 522 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 USP1O94782 785 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 TGFB3P10600 412 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 JUPP14923 745 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF365Q70YC5 407 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 KCNK18Q7Z418 384 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 CHSY1Q86X52 802 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 ADHFE1Q8IWW8 467 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 CLRN3Q8NCR9 226 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 KLHDC4Q8TBB5 520 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 COQ8BQ96D53 544 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 C7orf25Q9BPX7 421 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 IMPG2Q9BZV3 1241 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 HIPK2Q9H2X6 1198 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 IGSF5Q9NSI5 407 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 DKK3Q9UBP4 350 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 ICKQ9UPZ9 632 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 CD2APQ9Y5K6 639 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU2-38P-201ENST00000410856 SERINC4A6NH21 518 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU2-38P-201ENST00000410856 ANXA1P04083 346 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU2-38P-201ENST00000410856 T-ENOLP0DO92 83 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU2-38P-201ENST00000410856 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU2-38P-201ENST00000410856 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU2-38P-201ENST00000410856 NPY5RQ15761 445 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU2-38P-201ENST00000410856 LVRNQ6Q4G3 990 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU2-38P-201ENST00000410856 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMIEQ8NEW7 156 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU2-38P-201ENST00000410856 POC1BQ8TC44 478 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU2-38P-201ENST00000410856 USP7Q93009 1102 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU2-38P-201ENST00000410856 C8orf37Q96NL8 207 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU2-38P-201ENST00000410856 MDFICQ9P1T7 246 aa2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms