RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 MS4A4AQ96JQ5 239 aa27.45■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 CNTN6Q9UQ52 1028 aa27.45■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 VNN1O95497 513 aa27.44■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 LDHAP00338 332 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 CETPP11597 493 aa27.44■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 ACTR2P61160 394 aa27.44■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 MAMLD1Q13495 774 aa27.44■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 STAT4Q14765 748 aa27.44■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 CKAP2Q8WWK9 683 aa27.44■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 PLCD4Q9BRC7 762 aa27.44■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 C11orf70Q9BRQ4 267 aa27.44■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa27.44■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 ACTL7BQ9Y614 415 aa27.44■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 CFAP73A6NFT4 308 aa27.44■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 MGRN1O60291 552 aa27.44■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 GNA15P30679 374 aa27.44■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa27.44■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 SAPCD2Q86UD0 394 aa27.44■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 CCHCR1Q8TD31 782 aa27.44■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 CDH16O75309 829 aa27.43■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 RGS20O76081 388 aa27.43■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 TOMM70O94826 608 aa27.43■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 ABHD2P08910 425 aa27.43■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 TAS2R40P59535 323 aa27.43■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 TMEM132BQ14DG7 1078 aa27.43■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 EMC2Q15006 297 aa27.43■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 IZUMO3Q5VZ72 239 aa27.43■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 HEMGNQ9BXL5 484 aa27.43■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 CD248Q9HCU0 757 aa27.43■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 SUN1O94901 812 aa27.42■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 LLGL2Q6P1M3 1020 aa27.42■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 FAM212AQ96EL1 285 aa27.42■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 CGRRF1Q99675 332 aa27.42■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 MAF1Q9H063 256 aa27.42■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa27.42■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 TCP11X1B4DZS4 312 aa27.42■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 ATP2A1O14983 1001 aa27.42■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 CLTAP09496 248 aa27.42■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa27.42■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 BRAFP15056 766 aa27.42■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 OSBPP22059 807 aa27.42■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 GNPTABQ3T906 1256 aa27.42■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 FAM84AQ96KN4 292 aa27.42■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 KCNK9Q9NPC2 374 aa27.42■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 PARVAQ9NVD7 372 aa27.42■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 IP6K2Q9UHH9 426 aa27.42■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 SIP14410 1827 aa27.42■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa27.41■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 KLRC2P26717 231 aa27.41■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 NAMPTP43490 491 aa27.41■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 LRRC14Q15048 493 aa27.41■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 CCL15Q16663 113 aa27.41■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 MTERF2Q49AM1 385 aa27.41■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 SPOPLQ6IQ16 392 aa27.41■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 TMEM270Q6UE05 265 aa27.41■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 CCDC63Q8NA47 563 aa27.41■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 FEZF2Q8TBJ5 459 aa27.41■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 MGARPQ8TDB4 240 aa27.41■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa27.4■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 O00370 1275 aa27.4■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 ACOT2P49753 483 aa27.4■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 WNT7BP56706 349 aa27.4■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 C2CD6Q53TS8 623 aa27.4■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 LBX2Q6XYB7 198 aa27.4■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa27.4■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa27.4■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 PTPRJQ12913 1337 aa27.4■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 TLR3O15455 904 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 VPS41P49754 854 aa27.4■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 RCOR2Q8IZ40 523 aa27.4■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 BRI3BPQ8WY22 251 aa27.4■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 TEX13BQ9BXU2 312 aa27.4■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 PORCNQ9H237 461 aa27.4■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa27.4■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 CREB1P16220 341 aa27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms