RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466861.1

SUMO3-205, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2

Gene SUMO3, Length 753 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-205ENST00000466861 ATICP31939 592 aa25.09■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 VAMP7P51809 220 aa25.09■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 UVSSAQ2YD98 709 aa25.09■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 TPGS2Q68CL5 300 aa25.09■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 ISM2Q6H9L7 571 aa25.09■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 OVOS1Q6IE37 1185 aa25.09■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 CES5AQ6NT32 575 aa25.09■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 METTL23Q86XA0 190 aa25.09■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 PALB2Q86YC2 1186 aa25.09■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 ZNF461Q8TAF7 563 aa25.09■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 ZNF516Q92618 1163 aa25.09■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 CEP63Q96MT8 703 aa25.09■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 ADAM7Q9H2U9 754 aa25.09■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa25.09■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 FBXL5Q9UKA1 691 aa25.09■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 CDY1Q9Y6F8 540 aa25.09■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 TSC2P49815 1807 aa25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 CD44P16070 742 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 GTF2H1P32780 548 aa25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 BFSP1Q12934 665 aa25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 TMEM86AQ8N2M4 240 aa25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 MLKLQ8NB16 471 aa25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 KREMEN2Q8NCW0 462 aa25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 SUSD6Q92537 303 aa25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 HPDLQ96IR7 371 aa25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 VRTNQ9H8Y1 702 aa25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 MAN1C1Q9NR34 630 aa25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 PRKAG3Q9UGI9 489 aa25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-205ENST00000466861 HUS1O60921 280 aa25.07■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 ABLIM3O94929 683 aa25.07■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 HOXA9P31269 272 aa25.07■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 KCNQ1P51787 676 aa25.07■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 PMS1P54277 932 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 ROR1Q01973 937 aa25.07■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 ZACNQ401N2 412 aa25.07■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 TTI2Q6NXR4 508 aa25.07■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 THEM5Q8N1Q8 247 aa25.07■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 TOP6BLQ8N6T0 577 aa25.07■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 GPT2Q8TD30 523 aa25.07■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 NELFBQ8WX92 580 aa25.07■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 NECTIN4Q96NY8 510 aa25.07■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 ADAM12O43184 909 aa25.06■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 STX10O60499 249 aa25.06■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 POU2F2P09086 479 aa25.06■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 SMARCB1Q12824 385 aa25.06■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 PAK1Q13153 545 aa25.06■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 TRPC3Q13507 836 aa25.06■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 CCDC149Q6ZUS6 474 aa25.06■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 LIMS2Q7Z4I7 341 aa25.06■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa25.06■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 GLYCTKQ8IVS8 523 aa25.06■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 SPDYE4A6NLX3 237 aa25.05■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 PHACTR2O75167 634 aa25.05■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 ZMYND10O75800 440 aa25.05■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 CST3P01034 146 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 ATF2P15336 505 aa25.05■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 MTHFRP42898 656 aa25.05■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 LIN9Q5TKA1 542 aa25.05■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 KLHL10Q6JEL2 608 aa25.05■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 GPR149Q86SP6 731 aa25.05■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 RIPOR3Q96MK2 946 aa25.05■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 NCOR1O75376 2440 aa25.05■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 TRIM49BA6NDI0 452 aa25.04■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 DLG4P78352 724 aa25.04■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 BIRC3Q13489 604 aa25.04■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 CLUL1Q15846 466 aa25.04■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 ATAT1Q5SQI0 421 aa25.04■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 C1orf220Q5T0J3 134 aa25.04■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 WSCD1Q658N2 575 aa25.04■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 SV2AQ7L0J3 742 aa25.04■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 TAF4BQ92750 862 aa25.04■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 DACH1Q9UI36 760 aa25.04■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 RWDD2AQ9UIY3 292 aa25.04■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 SNX9Q9Y5X1 595 aa25.04■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 WDR27A2RRH5 827 aa25.03■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 GNA14O95837 355 aa25.03■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 LHX1P48742 406 aa25.03■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 GPR17Q13304 367 aa25.03■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 NCOA4Q13772 614 aa25.03■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 FRMD5Q7Z6J6 570 aa25.03■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 PDCL2Q8N4E4 241 aa25.03■■□□□ 1.6
SUMO3-205ENST00000466861 FAM84AQ96KN4 292 aa25.03■■□□□ 1.6
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