RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000099937.4

Ccdc58-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Ccdc58, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Axon, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Oxct2bQ9ESL0 520 aa14.76□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Oxct2aQ9JJN4 520 aa14.76□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Rfx5Q9JL61 658 aa14.76□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Tnfrsf10bQ9QZM4 381 aa14.76□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Noc2lQ9WV70 747 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Plce1Q8K4S1 2282 aa14.76□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Ptpn3A2ALK8 913 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 H2-T24F8VQG4 363 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Calhm3J3QMI4 347 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Usp35M0QWN7 1009 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Sema4dO09126 861 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Aldh1a7O35945 501 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 AfmO89020 608 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 GcP21614 476 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Irf8P23611 424 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Gjb3P28231 270 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Mfsd14aP70187 490 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Wbp1P97764 304 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Mtf2Q02395 593 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Cpne7Q0VE82 557 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Ccdc61Q3UJV1 511 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Bahd1Q497V6 772 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Lrrc47Q505F5 581 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Rnf43Q5NCP0 784 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Lrrn2Q6PHP6 730 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Znf598Q80YR4 908 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Leng9Q8BTN6 485 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Spata32Q8C5V0 334 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Naa30Q8CES0 364 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Them5Q9CQJ0 248 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Ribc1Q9D0B8 379 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 DlstQ9D2G2 454 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Mgat4dQ9D4R2 373 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Gdap2Q9DBL2 498 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Tpcn1Q9EQJ0 817 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Pkd2l2Q9JLG4 621 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 PdcQ9QW08 244 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Gm45208A0A140LJ36 292 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Gm38655A0A286YDK6 273 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Adamtsl5D3Z689 485 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Gm4307E9PZY4 289 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Gm4312K9J7E2 289 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Epb41l2O70318 988 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Cldn2O88552 230 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Tp53P02340 387 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 TyrP11344 533 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Lmo2P25801 158 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Tnfrsf4P47741 272 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Nek1P51954 1203 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Ntsr2P70310 416 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Trim71Q1PSW8 855 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Smyd5Q3TYX3 416 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Tmem164Q6PHN7 296 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Tas2r115Q7M719 310 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Polr2eQ80UW8 210 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Lrfn3Q8BLY3 626 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 R3hcc1Q8BSI6 488 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Rhpn2Q8BWR8 686 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Ccdc17Q8CE13 565 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Zbtb6Q8K088 423 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Gstt4Q9D4P7 240 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Nme7Q9QXL8 395 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Insl5Q9WUG6 135 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Bnip3lQ9Z2F7 218 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 MgaA2AWL7 3003 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Gm13090A2A899 111 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Dennd5bA2RSQ0 1274 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Wdr72D3YYM4 1114 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Vmn2r15L7N2A0 855 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 DtnbO70585 659 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 SrgnP13609 152 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Uba1yP31254 1058 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Folr1P35846 255 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Cracr2aQ3UP38 310 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Slc20a1Q61609 681 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Olfr1080Q7TR67 313 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 AgmoQ8BS35 447 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Pkn2Q8BWW9 983 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Rapgef5Q8C0Q9 814 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Setdb2Q8C267 713 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Cacnb2Q8CC27 655 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Unc45bQ8CGY6 931 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Psmd6Q99JI4 389 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Dnaaf1Q9D2H9 634 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Rassf7Q9DD19 359 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Gtf2ird1Q9JI57 1104 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Tex21Q9R0U9 575 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Clcn5Q9WVD4 746 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Oas1aP11928 367 aa14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Hoxd12P23812 268 aa14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Klf1P46099 358 aa14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 PtpaP58389 323 aa14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 SpoplQ2M2N2 392 aa14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Serac1Q3U213 654 aa14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 Srbd1Q497V5 1015 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Ccdc58-201ENSMUST00000099937 SynaQ5G5D5 617 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.3 ms