RNA–Protein interactions for RNA: YOR208W

PTP2, Transcript of Nuclear phosphotyrosine-specific phosphatase involved in osmosensing, yeast

Gene PTP2, Length 2,253 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PTP2	YOR208W	FAR7	P43592	221 aa		0.29	□□□□□ -2.36
PTP2	YOR208W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
PTP2	YOR208W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	0.29	□□□□□ -2.36
PTP2	YOR208W	YDL180W	Q12301	547 aa		0.29	□□□□□ -2.36
PTP2	YOR208W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
PTP2	YOR208W	KSS1	P14681	368 aa		0.28	□□□□□ -2.36
PTP2	YOR208W	BET1	P22804	142 aa		0.28	□□□□□ -2.36
PTP2	YOR208W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.36
PTP2	YOR208W	YBR209W	P38311	105 aa		0.28	□□□□□ -2.36
PTP2	YOR208W	SOK1	P40317	901 aa		0.28	□□□□□ -2.36
PTP2	YOR208W	YFL065C	P43539	102 aa		0.28	□□□□□ -2.36
PTP2	YOR208W	MIC26	P50087	233 aa		0.28	□□□□□ -2.36
PTP2	YOR208W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	SPO13	P23624	291 aa		0.27	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	SPS18	P32572	300 aa		0.27	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	OPY1	P38271	328 aa		0.27	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	FLX1	P40464	311 aa		0.27	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	YNG1	Q08465	219 aa		0.27	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	MGA1	P53050	456 aa		0.27	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	YMR252C	Q04814	134 aa		0.27	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	MER1	P16523	270 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	PPA2	P28239	310 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	TAF14	P35189	244 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	KDX1	P36005	433 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	TVP23	P38962	199 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	RMD6	P39975	231 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	YFH7	P43591	353 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	GCN3	P14741	305 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	COX15	P40086	486 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	PDR17	P53844	350 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	YML108W	Q03759	105 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	RNH202	Q05635	350 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	SEY1	Q99287	776 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	SSO1	P32867	290 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.25	□□□□□ -2.37	not detected
PTP2	YOR208W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	DGA1	Q08650	418 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	FIT2	Q08906	153 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	AIM25	P47140	327 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	RAD17	P48581	401 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	COG5	P53951	403 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	YLR460C	P54007	376 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	RCE1	Q03530	315 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	GGA1	Q06336	557 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	JLP1	Q12358	412 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	MDM35	O60200	86 aa		0.24	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	OTU1	P43558	301 aa		0.24	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	CWC27	Q02770	301 aa		0.24	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	YHR007C-A	Q07074	71 aa		0.24	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	YPR013C	Q12145	317 aa		0.24	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	YHL042W	P38729	150 aa		0.24	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	AIM36	Q03798	255 aa		0.24	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	GIS3	Q12418	502 aa		0.24	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	COX8	P04039	78 aa		0.23	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	OCH1	P31755	480 aa		0.23	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	IRC18	P47056	224 aa		0.23	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	IRC23	Q08416	157 aa		0.23	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	MSS2	P40990	351 aa		0.22	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	COA3	Q3E7B2	85 aa		0.22	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	YCR087C-A	P37263	153 aa		0.22	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	ODC2	Q99297	307 aa		0.22	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
PTP2	YOR208W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	SEN2	P16658	377 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	STE18	P18852	110 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	YMR007W	Q03675	126 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	LCL2	Q08045	131 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	RPB7	P34087	171 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PTP2	YOR208W	PAM17	P36147	197 aa		0.21	□□□□□ -2.38

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